Bioportal
BioPortal — NCBO's biomedical ontology repository (data.bioontology.org).
MCP-сервер · от pipeworx-io
Коротко
Bioportal: MCP-сервер, издатель pipeworx-io. Витрин, которые мы читаем и где он опубликован: 1 (Official MCP Registry). Мы впервые увидели его 2026-10-11 и с тех пор изменений не фиксировали. Данные нашего прохода по витринам на 2026-10-15.
Что просит
- Работает удалённо
Ни одна из витрин, которые мы читаем, не публикует его инструменты или настройки, которые он просит.
Что объявляет, просит и запускает, полностью
Устанавливайте плагины только от разработчиков, которым доверяете. Мы показываем то, что публикуют витрины, и не проверяем плагины.
Работает с
- Claude Code
- Codex
- Cursor
- VS Code
- Copilot CLI
Ссылка в один клик открывает клиент, и он просит подтвердить, прежде чем добавить сервер.
По маркетплейсам, где он опубликован, и объявленному транспорту MCP, как их документирует каждый клиент. Плагины мы не тестируем.
Подключить
Команды и конфигурации собраны только из того, что объявляют витрины. Мы не запускаем их за вас и не проверяем плагины.
Как удалённый MCP-сервер
Собрано из того, что объявляет Official MCP Registry.
claude mcp add --transport http bioportal https://gateway.pipeworx.io/bioportal/mcp[mcp_servers.bioportal]
url = "https://gateway.pipeworx.io/bioportal/mcp"{
"mcpServers": {
"bioportal": {
"url": "https://gateway.pipeworx.io/bioportal/mcp"
}
}
}Где опубликован
| Витрина | Статус | Версия | Числа | Проверен | Впервые замечен |
|---|---|---|---|---|---|
| Official MCP Registry (Открыть запись реестра) | Опубликован | 0.1.1 | Форки (GitHub): 0 Звёзды (GitHub): 0 |
Не помечен |
Каждое число принадлежит своей витрине и никогда не складывается с числами других витрин. Если витрина число не публикует, мы его не показываем: нет числа не значит ноль.
Что менялось
С тех пор как мы следим за плагином, ничего не менялось.
Похожие плагины
Продукты, чьи собственные названия, описания, инструменты и скиллы ближе всего по смыслу к этому, на всех витринах, которые мы читаем. Близость упорядочена только внутри этого списка.
-
cBioPortal MCP — cancer genomics portal.
-
Biomedical MCP server: genes, variants, trials, literature, patents, optional SQL/R/biowasm tools.
-
BioModels — the public repository of curated, executable mathematical models of biological systems…
-
genefoundry io.github.berntpopp/genefoundry
MCP gateway federating 22 biomedical MCP servers behind one endpoint: gnomAD, ClinVar, HPO, VEP.
-
50+ biomedical data sources in one MCP server — PubMed, ClinVar, gnomAD, KEGG, and more
-
site org.biobricks/site
BioBricks: the site's own MCP server — dataset, enquiry (enquiry = a human handoff, not a...
-
PubTator 3 MCP — biomedical entity search, literature search with entity
-
MetaboLights MCP — EBI's metabolomics study repository.
-
NCBI Datasets — the US National Library of Medicine's genome, gene and taxonomy reference service…
-
Bounded genomic data from archives and indexed files, with versioned reference evidence.
Похожие плагины по витринам
Тот же вопрос к каждой витрине по отдельности: есть ли там аналог этого плагина?
Есть на витрине Claude Code: claude-plugins-community (5)
-
mcp-server io.github.cap-js/mcp-server
Model Context Protocol (MCP) server for AI-assisted development of CAP applications.
-
Zero-config MCP server for searchable documentation. SQLite or PostgreSQL.
-
Multi-model deliberation over MCP: full responses plus typed cross-model reactions from other labs.
-
Community of Consciousness MCP Server — upload and explore collective wisdom via GitHub.
-
FastMCP server for surgical queries against a vault knowledge graph (NetworkX no
FastMCP server for surgical queries against a vault knowledge graph (NetworkX node-link JSON).…
Есть на витрине Claude Code: claude-plugins-official (5)
-
mcp-server io.github.cap-js/mcp-server
Model Context Protocol (MCP) server for AI-assisted development of CAP applications.
-
mdk-mcp-server io.github.SAP/mdk-mcp-server
Model Context Protocol (MCP) server for AI-assisted development of MDK applications.
-
mcp-grafana io.github.grafana/mcp-grafana
An MCP server giving access to Grafana dashboards, data and more.
-
Skills for designing and building MCP servers that work seamlessly with Claude. Guides you through deployment models (remote HTTP, MCPB, local), tool design patterns, auth, and…
-
Connect Claude to a private MCP server through an Anthropic MCP tunnel. The /create-docker-mcp-tunnel command drives the Docker Compose quickstart end to end: certificates, proxy…
Есть на витрине Claude: knowledge-work-plugins (5)
-
Connect to preclinical research tools and databases (literature search, genomics analysis, target prioritization) to accelerate early-stage life sciences R&D
-
Evidence-backed BioPharma research workflows over Maven Bio's drug, trial, company, and deal knowledge graph. Skills for competitive pipelines, indication landscapes, asset…
-
Search companies and contacts, enrich leads, find lookalikes, and get AI-ranked contact recommendations. Pre-built skills chain multiple ZoomInfo tools into complete B2B sales…
-
MCP server for terminal commands, file operations, and process management
-
gk-cli com.gitkraken/gk-cli
The GitKraken MCP Server for managing repos, PRs, issues across GitHub, GitLab, Bitbucket and more.
Есть на витрине Codex: openai-curated (openai/plugins) (5)
-
General life-sciences research workflows with query routing, evidence synthesis, and optional parallel subagent analysis across genetics, omics, biology, chemistry, structure…
-
Predict structures, screen molecules and proteins, and design binders.
-
Consensus is the go-to MCP for academic research. Connect directly to 220M+ peer-reviewed papers to search, synthesize, and build structured research outputs from within your…
-
Guided NGS intake, local execution, and public-pipeline routing for BCL, FASTQ, DNA variant, RNA-seq, single-cell, epigenomics, amplicon, and metagenomics analyses, with deeper…
-
Work with Zotero from Codex: search your library, export BibTeX, insert citations, and import references through the Zotero desktop app.
Есть на витрине Community GitHub marketplaces (5)
-
Database MCP server for schema discovery, comments, and SQL queries.
-
Repository-native protocol and local MCP server for Work, Docs, History and durable project Memory.
-
Build, audit and repair Power BI Desktop models and PBIP reports with DAX, TMDL and PBIR.
-
Source curation and typed Python graph construction with Biotope and BioCypher.
-
Google Search Console MCP for analytics, indexing, sitemaps, and SEO diagnostics.
Есть на витрине Copilot CLI: github/awesome-copilot (5)
-
Complete toolkit for building Model Context Protocol (MCP) servers in TypeScript/Node.js using the official SDK. Includes instructions for best practices, a prompt for generating…
-
Complete toolkit for building Model Context Protocol (MCP) servers in Go using the official github.com/modelcontextprotocol/go-sdk. Includes instructions for best practices, a…
-
Comprehensive resources for building Model Context Protocol servers using the official PHP SDK with attribute-based discovery, including best practices, project generation, and…
-
Build Model Context Protocol (MCP) servers in Java with the official MCP Java SDK 2.x. Includes a skill that generates a server project and an expert agent for guidance.
-
Complete toolkit for building Model Context Protocol (MCP) servers in Kotlin using the official io.modelcontextprotocol:kotlin-sdk library. Includes instructions for best…
Есть на витрине Copilot CLI: github/copilot-plugins (5)
-
mcp-apps
Generate MCP App widgets for MCP tools. Produces self-contained HTML widgets using the MCP Apps protocol.
-
power-automate
Build, edit, run, and debug Power Automate cloud flows via the FlowAgent MCP server — connection lifecycle, surgical edits, copy across environments, run management, and validated…
-
Build Power Apps Canvas Apps using the Canvas Authoring MCP server.
-
model-apps
Build and deploy Power Apps generative pages for model-driven apps with specialist agents for planning, entity creation, and parallel code generation. Requires PAC CLI >= 2.7.0…
-
Toolkit for building Microsoft 365 Copilot declarative agents — scaffolding, JSON manifest development, and capability configuration.
Есть на витрине Cursor: cursor/plugins (5)
-
Let Grok Bot reach MCP servers on your private Tailscale network. Sign in to Tailscale to connect your tailnet; Grok Bot joins it as one tagged device and only reaches the hosts…
-
Work with PostHog from chat: query product analytics and run SQL, manage feature flags and experiments, triage error tracking issues, and review session replays, surveys, and…
-
Search docs, read pages, and update tables.
-
Capture, search, and organize notes and collections.
-
Skills for building on the Cursor Origin API. Fetch the live spec first, then follow the Origin rules for credentials, scopes, webhooks, paging, and errors. Includes a skill that…
Есть на витрине Docker MCP Catalog (5)
-
Official ClickHouse MCP server for querying and exploring ClickHouse clusters and chDB.
-
mcp-neo4j-data-modeling io.github.neo4j-contrib/mcp-neo4j-data-modeling
A simple Neo4j MCP server for creating graph data models.
-
Remote MCP server for the Hackle Admin API: experiments, feature flags, remote config, messaging.
-
Dynatrace-mcp io.github.dynatrace-oss/Dynatrace-mcp
[DEPRECATED] Dynatrace MCP Server. Migrate to dynatrace-for-ai or Dynatrace Remote MCP Server.
-
mcp-server-couchbase io.github.Couchbase-Ecosystem/mcp-server-couchbase
Couchbase Model Context Protocol Server to interact with Couchbase clusters
Есть на витрине Official MCP Registry (5)
-
cBioPortal MCP — cancer genomics portal.
-
Biomedical MCP server: genes, variants, trials, literature, patents, optional SQL/R/biowasm tools.
-
BioModels — the public repository of curated, executable mathematical models of biological systems…
-
genefoundry io.github.berntpopp/genefoundry
MCP gateway federating 22 biomedical MCP servers behind one endpoint: gnomAD, ClinVar, HPO, VEP.
-
50+ biomedical data sources in one MCP server — PubMed, ClinVar, gnomAD, KEGG, and more
Найдено по смыслу, а не по общему коду или репозиторию: похожие плагины остаются разными продуктами, и это не обзор и не рекомендация.
Хотите такой знак у своего плагина в нашем каталоге?
Докажите, что поддерживаете его, файлом в репозитории, файлом на вашем домене или DNS-записью, и сможете показать этот знак на карточке, а ещё живые баннеры для сайта и README. Как проходит подтверждение
Ещё вы будете получать уведомления, когда витрина добавит плагин, снимет его, изменит отметку verified или список того, что он просит, а его удалённый endpoint встанет на мониторинг как веб-сервис.
Данные витрины Official MCP Registry. Числа взяты из наших регулярных обходов витрин, последняя проверка . Контакты издателей плагинов мы не публикуем.