io.github.mrfentmen/ncbi-datasets-mcp
NCBI Datasets: genome assemblies by taxon, gene records by symbol and taxonomy lookups
MCP-сервер · от mrfentmen
Коротко
io.github.mrfentmen/ncbi-datasets-mcp: MCP-сервер, издатель mrfentmen. Витрин, которые мы читаем и где он опубликован: 1 (Official MCP Registry). Мы впервые увидели его 2026-10-28 и с тех пор изменений не фиксировали. Данные нашего прохода по витринам на 2026-11-03.
Что просит
- Работает на вашем компьютере
Ни одна из витрин, которые мы читаем, не публикует его инструменты или настройки, которые он просит.
Что объявляет, просит и запускает, полностью
Устанавливайте плагины только от разработчиков, которым доверяете. Мы показываем то, что публикуют витрины, и не проверяем плагины.
Работает с
- Claude Code
- Codex
- Cursor
- VS Code
- Copilot CLI
Ссылка в один клик открывает клиент, и он просит подтвердить, прежде чем добавить сервер.
По маркетплейсам, где он опубликован, и объявленному транспорту MCP, как их документирует каждый клиент. Плагины мы не тестируем.
Подключить
Команды и конфигурации собраны только из того, что объявляют витрины. Мы не запускаем их за вас и не проверяем плагины.
Как локальный MCP-сервер: пакет npm
Собрано из того, что объявляет Official MCP Registry.
claude mcp add --transport stdio ncbi-datasets-mcp -- npx -y @mrfentmen/ncbi-datasets-mcp[mcp_servers.ncbi-datasets-mcp]
command = "npx"
args = ["-y", "@mrfentmen/ncbi-datasets-mcp"]{
"mcpServers": {
"ncbi-datasets-mcp": {
"command": "npx",
"args": [
"-y",
"@mrfentmen/ncbi-datasets-mcp"
]
}
}
}Где опубликован
| Витрина | Статус | Версия | Числа | Проверен | Впервые замечен |
|---|---|---|---|---|---|
| Official MCP Registry (Открыть запись реестра) | Опубликован | 1.0.1 | Форки (GitHub): 0 Звёзды (GitHub): 0 |
Не помечен |
Каждое число принадлежит своей витрине и никогда не складывается с числами других витрин. Если витрина число не публикует, мы его не показываем: нет числа не значит ноль.
Что менялось
- Стал продуктом, за которым мы следим
- Official MCP Registry: появился
Похожие плагины
Продукты, чьи собственные названия, описания, инструменты и скиллы ближе всего по смыслу к этому, на всех витринах, которые мы читаем. Близость упорядочена только внутри этого списка.
-
ensembl-mcp io.github.mrfentmen/ensembl-mcp
Genome lookup from Ensembl. No key required.
-
mygene-mcp io.github.mrfentmen/mygene-mcp
Gene annotations from mygene.info: search genes by symbol or keyword and read full records
-
Bounded genomic data from archives and indexed files, with versioned reference evidence.
-
ucsc-genome-mcp io.github.mrfentmen/ucsc-genome-mcp
UCSC Genome Browser: list genomes, fetch DNA ranges and search genes by name
-
ensembl-mcp-server io.github.cyanheads/ensembl-mcp-server
Look up genes, sequences, variants, homologs, and cross-database xrefs from Ensembl REST.
-
ncbi-gene-mcp io.github.mrfentmen/ncbi-gene-mcp
NCBI Gene records: search by symbol, disease or chromosome and read names, location, aliases and
-
50+ biomedical data sources in one MCP server — PubMed, ClinVar, gnomAD, KEGG, and more
-
opentargets io.github.nickzren/opentargets
Read-only Open Targets: targets, diseases, drugs and evidence by name or ID. No API key needed.
-
ebi-search-mcp io.github.mrfentmen/ebi-search-mcp
EBI Search API: search EMBL-EBI biomedical databases.
-
hgnc-mcp io.github.mrfentmen/hgnc-mcp
HGNC gene nomenclature: search genes by symbol, alias or id, and read approved names
Похожие плагины по витринам
Тот же вопрос к каждой витрине по отдельности: есть ли там аналог этого плагина?
Есть на витрине Claude Code: claude-plugins-community (5)
-
197 ready-to-use life sciences skills that turn Claude into a domain expert for genomics, proteomics, drug discovery, biostatistics, scientific computing, and scientific writing…
-
Zero-config MCP server for searchable documentation. SQLite or PostgreSQL.
-
AI-native ontology engineering with 39 MCP tools backed by an in-memory Oxigraph triple store. Build, validate, query, and govern RDF/OWL ontologies using a…
-
nodebench io.github.HomenShum/nodebench
260 MCP tools across 49 domains. AI Flywheel, quality gates, research, web scraping.
-
agent-discover io.github.keshrath/agent-discover
Find, install and enable MCP servers mid-session on any host, with consent and tool pinning
Есть на витрине Claude Code: claude-plugins-official (5)
-
Create, connect, and interact with an AlloyDB for PostgreSQL database and data.
-
Atlan data catalog plugin for Claude Code. Search, explore, govern, and manage your data assets through natural language. Powered by the Atlan MCP server with semantic search…
-
DataHub development and interaction toolkit with connector planning, PR review, catalog search, metadata enrichment, lineage tracing, data quality management, and connection setup…
-
An authenticated hosted MCP server that accesses your PlanetScale organizations, databases, branches, schema, and Insights data. Query against your data, surface slow queries, and…
-
Skills for creating MCP Apps with the MCP Apps SDK
Есть на витрине Claude: knowledge-work-plugins (5)
-
Connect to preclinical research tools and databases (literature search, genomics analysis, target prioritization) to accelerate early-stage life sciences R&D
-
Evidence-backed BioPharma research workflows over Maven Bio's drug, trial, company, and deal knowledge graph. Skills for competitive pipelines, indication landscapes, asset…
-
Atlan data catalog plugin for Claude Code. Search, explore, govern, and manage your data assets through natural language. Powered by the Atlan MCP server with semantic search…
-
Search companies and contacts, enrich leads, find lookalikes, and get AI-ranked contact recommendations. Pre-built skills chain multiple ZoomInfo tools into complete B2B sales…
-
An authenticated hosted MCP server that accesses your PlanetScale organizations, databases, branches, schema, and Insights data. Query against your data, surface slow queries, and…
Есть на витрине Codex: openai-curated (openai/plugins) (5)
-
General life-sciences research workflows with query routing, evidence synthesis, and optional parallel subagent analysis across genetics, omics, biology, chemistry, structure…
-
Guided NGS intake, local execution, and public-pipeline routing for BCL, FASTQ, DNA variant, RNA-seq, single-cell, epigenomics, amplicon, and metagenomics analyses, with deeper…
-
Predict structures, screen molecules and proteins, and design binders.
-
Skills for NVIDIAs ecosystem spans GPU acceleration, CUDA, AI agents, inference, robotics, Physical AI, Omniverse, and simulation. This plugin helps you understand the pieces…
-
Consensus is the go-to MCP for academic research. Connect directly to 220M+ peer-reviewed papers to search, synthesize, and build structured research outputs from within your…
Есть на витрине Community GitHub marketplaces (5)
-
scientific-databases
Programmatic access to public scientific databases and APIs.
-
20 MCP tools + 48 skills for ENCODE Project genomics — search, download, pipelines
-
Read-only biomedical search and evidence retrieval across BioMCP's CLI command grammar (genes, variants, trials, articles, drugs, diseases, pathways, proteins, and more). Wires…
-
biology-research
Genomics and bioinformatics, from data analysis to publication.
-
Run metadata-aware predictions and fine-tune AlphaGenome-PyTorch on custom genomic tracks.
Есть на витрине Copilot CLI: github/awesome-copilot (5)
-
Complete toolkit for building Model Context Protocol (MCP) servers in Go using the official github.com/modelcontextprotocol/go-sdk. Includes instructions for best practices, a…
-
Complete toolkit for building Model Context Protocol (MCP) servers in TypeScript/Node.js using the official SDK. Includes instructions for best practices, a prompt for generating…
-
Safe BLE diagnostics, evidence workflows, and guarded automation for AI agents.
-
Explore and query TimeBase streams, schemas, QQL, symbols, and server status via MCP.
-
Figma design platform integration. Access design files, extract component information, read design tokens, and translate designs into code. Bridge the gap between design and…
Есть на витрине Copilot CLI: github/copilot-plugins (5)
-
mcp-apps
Generate MCP App widgets for MCP tools. Produces self-contained HTML widgets using the MCP Apps protocol.
-
Build Power Apps Canvas Apps using the Canvas Authoring MCP server.
-
model-apps
Build and deploy Power Apps generative pages for model-driven apps with specialist agents for planning, entity creation, and parallel code generation. Requires PAC CLI >= 2.7.0…
-
Toolkit for building Microsoft 365 Copilot declarative agents — scaffolding, JSON manifest development, and capability configuration.
-
workiq
Query Microsoft 365 data with natural language — emails, meetings, documents, Teams messages, and more.
Есть на витрине Cursor: cursor/plugins (5)
-
Ask Databricks Genie questions about your workspace's data in plain language.
-
Fan large tasks out across parallel cloud agents with planners, workers, verifiers, and structured handoffs.
-
Explore datasets and tables and run SQL queries.
-
CLI-backed repo compatibility scans plus agents that audit startup, validation, and docs against reality.
-
Work with PostHog from chat: query product analytics and run SQL, manage feature flags and experiments, triage error tracking issues, and review session replays, surveys, and…
Есть на витрине Docker MCP Catalog (5)
-
Generate, run, debug lifescience workflows.
-
The Official Model Context Protocol (MCP) server for Kagi Search & other tools.
-
An MCP server to help make U.S. Government open datasets AI-friendly.
-
A Model Context Protocol (MCP) server implementation that provides database capabilities for Chroma.
-
Read and score Opik traces, experiments, datasets and prompts from your AI assistant.
Есть на витрине Official MCP Registry (5)
-
ensembl-mcp io.github.mrfentmen/ensembl-mcp
Genome lookup from Ensembl. No key required.
-
mygene-mcp io.github.mrfentmen/mygene-mcp
Gene annotations from mygene.info: search genes by symbol or keyword and read full records
-
Bounded genomic data from archives and indexed files, with versioned reference evidence.
-
ucsc-genome-mcp io.github.mrfentmen/ucsc-genome-mcp
UCSC Genome Browser: list genomes, fetch DNA ranges and search genes by name
-
ensembl-mcp-server io.github.cyanheads/ensembl-mcp-server
Look up genes, sequences, variants, homologs, and cross-database xrefs from Ensembl REST.
Есть на витрине PyPI (MCP servers) (5)
-
opentargets io.github.nickzren/opentargets
Read-only Open Targets: targets, diseases, drugs and evidence by name or ID. No API key needed.
-
Find & fetch research datasets across 21 archives, omics registries, and literature sources.
-
MCP server for AlphaFold and 8 other biomedical data sources with a local SQLite knowledge graph
-
Verifiable, release-aware protein evidence workflows over UniProt and linked scientific sources.
-
galaxy-mcp io.github.galaxyproject/galaxy-mcp
MCP server for Galaxy bioinformatics platform - connect, execute tools, and manage workflows
Есть на витрине npm registry (MCP servers) (5)
-
ensembl-mcp-server io.github.cyanheads/ensembl-mcp-server
Look up genes, sequences, variants, homologs, and cross-database xrefs from Ensembl REST.
-
uniprot-mcp-server io.github.cyanheads/uniprot-mcp-server
Protein research over UniProtKB: search by function, fetch curated records, map IDs, proteomes.
-
gbif-biodiversity-mcp-server io.github.cyanheads/gbif-biodiversity-mcp-server
Search GBIF species taxonomy, occurrence records, datasets, and publishers.
-
paleobiology-mcp-server io.github.cyanheads/paleobiology-mcp-server
Search fossil occurrences, taxon ranges, diversity through deep time, and the geologic time scale.
-
datacite-mcp-server io.github.cyanheads/datacite-mcp-server
Search DataCite datasets and software, fetch DOI metadata, trace relations, format citations.
Найдено по смыслу, а не по общему коду или репозиторию: похожие плагины остаются разными продуктами, и это не обзор и не рекомендация.
Хотите такой знак у своего плагина в нашем каталоге?
Докажите, что поддерживаете его, файлом в репозитории, файлом на вашем домене или DNS-записью, и сможете показать этот знак на карточке, а ещё живые баннеры для сайта и README. Как проходит подтверждение
Ещё вы будете получать уведомления, когда витрина добавит плагин, снимет его, изменит отметку verified или список того, что он просит, а его удалённый endpoint встанет на мониторинг как веб-сервис.
Данные витрины Official MCP Registry. Числа взяты из наших регулярных обходов витрин, последняя проверка . Контакты издателей плагинов мы не публикуем.