Ext Ops Panel
Открыть панель

io.github.mrfentmen/pdb-mcp

RCSB PDB: search 230k+ structures, read chains, ligands, formulas and citations — keyless.

MCP-сервер · от mrfentmen

Подключить Сравнить Это мой

Коротко

io.github.mrfentmen/pdb-mcp: MCP-сервер, издатель mrfentmen. Витрин, которые мы читаем и где он опубликован: 1 (Official MCP Registry). Мы впервые увидели его 2026-10-27 и с тех пор изменений не фиксировали. Данные нашего прохода по витринам на 2026-11-06.

Что просит

  • Работает на вашем компьютере

Ни одна из витрин, которые мы читаем, не публикует его инструменты или настройки, которые он просит.

Что объявляет, просит и запускает, полностью

Устанавливайте плагины только от разработчиков, которым доверяете. Мы показываем то, что публикуют витрины, и не проверяем плагины.

Работает с

  • Claude Code
  • Codex
  • Cursor
  • VS Code
  • Copilot CLI
Установить в CursorУстановить в VS Code

Ссылка в один клик открывает клиент, и он просит подтвердить, прежде чем добавить сервер.

По маркетплейсам, где он опубликован, и объявленному транспорту MCP, как их документирует каждый клиент. Плагины мы не тестируем.

Подключить

Команды и конфигурации собраны только из того, что объявляют витрины. Мы не запускаем их за вас и не проверяем плагины.

Как локальный MCP-сервер: пакет npm

Собрано из того, что объявляет Official MCP Registry.

Claude CodeТерминал
claude mcp add --transport stdio pdb-mcp -- npx -y pdb-mcp
Codex~/.codex/config.toml
[mcp_servers.pdb-mcp]
command = "npx"
args = ["-y", "pdb-mcp"]
Cursor~/.cursor/mcp.json
{
  "mcpServers": {
    "pdb-mcp": {
      "command": "npx",
      "args": [
        "-y",
        "pdb-mcp"
      ]
    }
  }
}

Где опубликован

ВитринаСтатусВерсияЧислаПроверенВпервые замечен
Official MCP Registry (Открыть запись реестра) Опубликован 1.0.0 Форки (GitHub): 0
Звёзды (GitHub): 0		 Не помечен

Каждое число принадлежит своей витрине и никогда не складывается с числами других витрин. Если витрина число не публикует, мы его не показываем: нет числа не значит ноль.

Что менялось

  1. Стал продуктом, за которым мы следим
  2. Official MCP Registry: появился

Похожие плагины

Продукты, чьи собственные названия, описания, инструменты и скиллы ближе всего по смыслу к этому, на всех витринах, которые мы читаем. Близость упорядочена только внутри этого списка.

  • RCSB PDB

    MCP server to search, inspect, and cross-reference RCSB Protein Data Bank structures

    от rcsb · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry · Решает почти ту же задачу

  • protein-mcp-server io.github.cyanheads/protein-mcp-server

    Federated protein structure & annotation across experimental (PDB) and predicted (AlphaFold) models.

    от cyanheads · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, npm registry (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

  • uniprot-mcp-server io.github.cyanheads/uniprot-mcp-server

    Protein research over UniProtKB: search by function, fetch curated records, map IDs, proteomes.

    от cyanheads · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, npm registry (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

  • rcsb-pdb-mcp io.github.mrfentmen/rcsb-pdb-mcp

    Look up protein structures and search the RCSB Protein Data Bank. No key required.

    от mrfentmen · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry · Решает похожую задачу

  • ebi-search-mcp io.github.mrfentmen/ebi-search-mcp

    EBI Search API: search EMBL-EBI biomedical databases.

    от mrfentmen · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry · Решает похожую задачу

  • Pubchem

    PubChem MCP — NIH chemistry compound database (no auth)

    от pipeworx-io · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry · Решает похожую задачу

  • interpro-mcp-server io.github.cyanheads/interpro-mcp-server

    Search InterPro entries, map domains onto proteins and PDB structures, and scan raw sequences.

    от cyanheads · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry · Решает похожую задачу

  • Rcsb Pdb

    RCSB PDB MCP — experimentally determined macromolecular structures.

    от pipeworx-io · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry · Решает похожую задачу

  • alphafold-mcp io.github.mrfentmen/alphafold-mcp

    Keyless MCP server for AlphaFold: protein structure predictions by UniProt accession, confidence...

    от mrfentmen · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry · Решает похожую задачу

  • emdb-mcp io.github.mrfentmen/emdb-mcp

    EBI Electron Microscopy Data Bank: search cryo-EM maps and read resolution and method

    от mrfentmen · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry · Решает похожую задачу

Похожие плагины по витринам

Тот же вопрос к каждой витрине по отдельности: есть ли там аналог этого плагина?

Есть на витрине Claude Code: claude-plugins-community (5)

  • Gnosis MCP

    Zero-config MCP server for searchable documentation. SQLite or PostgreSQL.

    от nicholasglazer · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, Claude Code: claude-plugins-community, PyPI (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

  • mdk-mcp-server io.github.SAP/mdk-mcp-server

    Model Context Protocol (MCP) server for AI-assisted development of MDK applications.

    от SAP · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, Claude Code: claude-plugins-official, Claude Code: claude-plugins-community · Решает почти ту же задачу

  • nodebench io.github.HomenShum/nodebench

    260 MCP tools across 49 domains. AI Flywheel, quality gates, research, web scraping.

    от HomenShum · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, Claude Code: claude-plugins-community · Решает почти ту же задачу

  • mcp-server io.github.cap-js/mcp-server

    Model Context Protocol (MCP) server for AI-assisted development of CAP applications.

    от cap-js · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, Claude Code: claude-plugins-official, Claude Code: claude-plugins-community · Решает почти ту же задачу

  • socraticode io.github.giancarloerra/socraticode

    MCP server for enterprise local codebase indexing, semantic search, and code dependency graphs.

    от giancarloerra · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, Claude Code: claude-plugins-community, Community GitHub marketplaces · Решает почти ту же задачу

Есть на витрине Claude Code: claude-plugins-official (5)

  • mdk-mcp-server io.github.SAP/mdk-mcp-server

    Model Context Protocol (MCP) server for AI-assisted development of MDK applications.

    от SAP · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, Claude Code: claude-plugins-official, Claude Code: claude-plugins-community · Решает почти ту же задачу

  • mcp-server io.github.cap-js/mcp-server

    Model Context Protocol (MCP) server for AI-assisted development of CAP applications.

    от cap-js · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, Claude Code: claude-plugins-official, Claude Code: claude-plugins-community · Решает почти ту же задачу

  • mcp-server-dev

    Skills for designing and building MCP servers that work seamlessly with Claude. Guides you through deployment models (remote HTTP, MCPB, local), tool design patterns, auth, and…

    от Anthropic · Пакет плагинов

    Опубликован: Claude Code: claude-plugins-official · Решает почти ту же задачу

  • boltz

    Predict structures, screen molecules and proteins, and design binders with Boltz from Claude Code.

    от boltz-bio · Пакет плагинов

    Опубликован: Claude Code: claude-plugins-official, Claude Code: claude-plugins-community · Решает почти ту же задачу

  • Grafana

    An MCP server giving access to Grafana dashboards, data and more.

    от grafana · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, Claude Code: claude-plugins-official, Docker MCP Catalog, Claude Code: claude-plugins-community · Решает почти ту же задачу

Есть на витрине Claude: knowledge-work-plugins (5)

  • figma

    Figma design platform integration. Access design files, extract component information, read design tokens, and translate designs into code. Bridge the gap between design and…

    от figma · Пакет плагинов

    Опубликован: Claude Code: claude-plugins-official, Official MCP Registry, Claude: knowledge-work-plugins, Copilot CLI: github/awesome-copilot · Решает почти ту же задачу

  • Desktop Commander

    MCP server for terminal commands, file operations, and process management

    от wonderwhy-er · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, Claude Code: claude-plugins-official, Docker MCP Catalog, Claude: knowledge-work-plugins, Claude Code: claude-plugins-community, Community GitHub marketplaces, npm registry (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

  • Bio Research

    Connect to preclinical research tools and databases (literature search, genomics analysis, target prioritization) to accelerate early-stage life sciences R&D

    от Anthropic · Пакет плагинов

    Опубликован: Claude: knowledge-work-plugins · Решает почти ту же задачу

  • zoominfo

    Search companies and contacts, enrich leads, find lookalikes, and get AI-ranked contact recommendations. Pre-built skills chain multiple ZoomInfo tools into complete B2B sales…

    от Zoominfo · Пакет плагинов

    Опубликован: Claude Code: claude-plugins-official, Official MCP Registry, Claude: knowledge-work-plugins · Решает почти ту же задачу

  • planetscale

    An authenticated hosted MCP server that accesses your PlanetScale organizations, databases, branches, schema, and Insights data. Query against your data, surface slow queries, and…

    от planetscale · Пакет плагинов

    Опубликован: Claude Code: claude-plugins-official, Claude: knowledge-work-plugins, Claude Code: claude-plugins-community · Решает почти ту же задачу

Есть на витрине Codex: openai-curated (openai/plugins) (5)

  • Boltz

    Predict structures, screen molecules and proteins, and design binders.

    от Boltz · Пакет плагинов

    Опубликован: Codex: openai-curated (openai/plugins) · Решает почти ту же задачу

  • Life Science Research

    General life-sciences research workflows with query routing, evidence synthesis, and optional parallel subagent analysis across genetics, omics, biology, chemistry, structure…

    от OpenAI · Пакет плагинов

    Опубликован: Codex: openai-curated (openai/plugins) · Решает почти ту же задачу

  • NVIDIA

    Skills for NVIDIAs ecosystem spans GPU acceleration, CUDA, AI agents, inference, robotics, Physical AI, Omniverse, and simulation. This plugin helps you understand the pieces…

    от NVIDIA · Пакет плагинов

    Опубликован: Codex: openai-curated (openai/plugins) · Решает похожую задачу

  • Consensus

    Consensus is the go-to MCP for academic research. Connect directly to 220M+ peer-reviewed papers to search, synthesize, and build structured research outputs from within your…

    от Consensus · Пакет плагинов

    Опубликован: Codex: openai-curated (openai/plugins) · Решает похожую задачу

  • MagicPath

    Use MagicPath to find, inspect, install, create, and edit UI components from Codex.

    от MagicPathAI · Пакет плагинов

    Опубликован: Codex: openai-curated (openai/plugins) · Решает похожую задачу

Есть на витрине Community GitHub marketplaces (5)

  • arxiv-mcp-server io.github.blazickjp/arxiv-mcp-server

    Search arXiv papers, download full text, semantic search, citation graphs, and alerts via MCP.

    от blazickjp · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, PyPI (MCP servers), Community GitHub marketplaces · Решает почти ту же задачу

  • tooluniverse io.github.mims-harvard/tooluniverse

    2,700+ scientific tools for AI scientists: life science, research, literature, and more.

    от mims-harvard · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, Community GitHub marketplaces · Решает почти ту же задачу

  • biomcp

    Read-only biomedical search and evidence retrieval across BioMCP's CLI command grammar (genes, variants, trials, articles, drugs, diseases, pathways, proteins, and more). Wires…

    от GenomOncology · Пакет плагинов

    Опубликован: Community GitHub marketplaces · Решает почти ту же задачу

  • jDataMunch MCP

    Tabular data retrieval. Index CSV/Excel, query rows, aggregate. 99%+ savings vs raw file reads.

    от jgravelle · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, PyPI (MCP servers), Community GitHub marketplaces · Решает почти ту же задачу

  • socraticode io.github.giancarloerra/socraticode

    MCP server for enterprise local codebase indexing, semantic search, and code dependency graphs.

    от giancarloerra · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, Claude Code: claude-plugins-community, Community GitHub marketplaces · Решает почти ту же задачу

Есть на витрине Copilot CLI: github/awesome-copilot (5)

  • go-mcp-development

    Complete toolkit for building Model Context Protocol (MCP) servers in Go using the official github.com/modelcontextprotocol/go-sdk. Includes instructions for best practices, a…

    от Awesome Copilot Community · Пакет плагинов

    Опубликован: Copilot CLI: github/awesome-copilot · Решает почти ту же задачу

  • typescript-mcp-development

    Complete toolkit for building Model Context Protocol (MCP) servers in TypeScript/Node.js using the official SDK. Includes instructions for best practices, a prompt for generating…

    от Awesome Copilot Community · Пакет плагинов

    Опубликован: Copilot CLI: github/awesome-copilot · Решает почти ту же задачу

  • TimeBase

    Explore and query TimeBase streams, schemas, QQL, symbols, and server status via MCP.

    от epam · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, Copilot CLI: github/awesome-copilot, PyPI (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

  • kotlin-mcp-development

    Complete toolkit for building Model Context Protocol (MCP) servers in Kotlin using the official io.modelcontextprotocol:kotlin-sdk library. Includes instructions for best…

    от Awesome Copilot Community · Пакет плагинов

    Опубликован: Copilot CLI: github/awesome-copilot · Решает почти ту же задачу

  • php-mcp-development

    Comprehensive resources for building Model Context Protocol servers using the official PHP SDK with attribute-based discovery, including best practices, project generation, and…

    от Awesome Copilot Community · Пакет плагинов

    Опубликован: Copilot CLI: github/awesome-copilot · Решает почти ту же задачу

Есть на витрине Copilot CLI: github/copilot-plugins (5)

  • mcp-apps

    Generate MCP App widgets for MCP tools. Produces self-contained HTML widgets using the MCP Apps protocol.

    от microsoft · Пакет плагинов

    Опубликован: Copilot CLI: github/copilot-plugins · Решает почти ту же задачу

  • canvas-apps

    Build Power Apps Canvas Apps using the Canvas Authoring MCP server.

    от microsoft · Пакет плагинов

    Опубликован: Copilot CLI: github/copilot-plugins · Решает почти ту же задачу

  • model-apps

    Build and deploy Power Apps generative pages for model-driven apps with specialist agents for planning, entity creation, and parallel code generation. Requires PAC CLI >= 2.7.0…

    от microsoft · Пакет плагинов

    Опубликован: Copilot CLI: github/copilot-plugins · Решает почти ту же задачу

  • cpp-language-server

    Navigate and interact with your C++ code using the Microsoft C++ Language Server.

    от microsoft · Пакет плагинов

    Опубликован: Copilot CLI: github/copilot-plugins · Решает почти ту же задачу

  • microsoft-365-agents-toolkit

    Toolkit for building Microsoft 365 Copilot declarative agents — scaffolding, JSON manifest development, and capability configuration.

    от microsoft · Пакет плагинов

    Опубликован: Copilot CLI: github/copilot-plugins · Решает похожую задачу

Есть на витрине Cursor: cursor/plugins (5)

  • Tailscale

    Let Grok Bot reach MCP servers on your private Tailscale network: connect your own tailnet, or your team's company tailnets turned on by a team admin, with each member using their…

    от Cursor · Пакет плагинов

    Опубликован: Cursor: cursor/plugins · Решает почти ту же задачу

  • Cursor SDK

    Build apps, scripts, and automations with the TypeScript SDK.

    от Cursor · Пакет плагинов

    Опубликован: Cursor: cursor/plugins · Решает почти ту же задачу

  • Agent Compatibility

    CLI-backed repo compatibility scans plus agents that audit startup, validation, and docs against reality.

    от Cursor · Пакет плагинов

    Опубликован: Cursor: cursor/plugins · Решает почти ту же задачу

  • Power BI

    Browse Microsoft Power BI workspaces and render report pages.

    от Cursor · Пакет плагинов

    Опубликован: Cursor: cursor/plugins · Решает почти ту же задачу

  • playwright-mcp io.github.microsoft/playwright-mcp

    Playwright Tools for MCP

    от microsoft · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, Claude Code: claude-plugins-official, Cursor: cursor/plugins, Docker MCP Catalog, Community GitHub marketplaces · Решает почти ту же задачу

Есть на витрине Docker MCP Catalog (5)

  • Rube

    Access to Rube's catalog of remote MCP servers.

    от docker · MCP-сервер

    Опубликован: Docker MCP Catalog · Решает почти ту же задачу

  • Git (Reference)

    Git repository interaction and automation.

    от modelcontextprotocol · MCP-сервер

    Опубликован: Docker MCP Catalog, PyPI (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

  • Kagi Search

    The Official Model Context Protocol (MCP) server for Kagi Search & other tools.

    от kagisearch · MCP-сервер

    Опубликован: Docker MCP Catalog · Решает почти ту же задачу

  • npm-sentinel-mcp io.github.Nekzus/npm-sentinel-mcp

    Advanced NPM analysis: Recursive security scanning, ecosystem awareness, and deep insights.

    от Nekzus · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, Docker MCP Catalog, npm registry (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

  • Firecrawl MCP Server

    Firecrawl, the context API for AI agents: search, scrape, interact with the web, plus paper search.

    от firecrawl · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, Docker MCP Catalog, Community GitHub marketplaces · Решает почти ту же задачу

Есть на витрине Official MCP Registry (5)

  • RCSB PDB

    MCP server to search, inspect, and cross-reference RCSB Protein Data Bank structures

    от rcsb · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry · Решает почти ту же задачу

  • protein-mcp-server io.github.cyanheads/protein-mcp-server

    Federated protein structure & annotation across experimental (PDB) and predicted (AlphaFold) models.

    от cyanheads · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, npm registry (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

  • uniprot-mcp-server io.github.cyanheads/uniprot-mcp-server

    Protein research over UniProtKB: search by function, fetch curated records, map IDs, proteomes.

    от cyanheads · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, npm registry (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

  • rcsb-pdb-mcp io.github.mrfentmen/rcsb-pdb-mcp

    Look up protein structures and search the RCSB Protein Data Bank. No key required.

    от mrfentmen · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry · Решает похожую задачу

  • ebi-search-mcp io.github.mrfentmen/ebi-search-mcp

    EBI Search API: search EMBL-EBI biomedical databases.

    от mrfentmen · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry · Решает похожую задачу

Есть на витрине PyPI (MCP servers) (5)

  • AlphaFold Sovereign MCP

    MCP server for AlphaFold and 8 other biomedical data sources with a local SQLite knowledge graph

    от smaniches · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, PyPI (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

  • UniProt MCP

    Verifiable, release-aware protein evidence workflows over UniProt and linked scientific sources.

    от smaniches · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, PyPI (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

  • ChemDraw MCP (unofficial)

    Molecule names or SMILES to 2D structures, reactions, mechanisms, spectra - offline via RDKit.

    от jurimaxam-dotcom · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, PyPI (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

  • arxiv-mcp-server io.github.blazickjp/arxiv-mcp-server

    Search arXiv papers, download full text, semantic search, citation graphs, and alerts via MCP.

    от blazickjp · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, PyPI (MCP servers), Community GitHub marketplaces · Решает почти ту же задачу

  • dbt-mcp

    A MCP (Model Context Protocol) server for interacting with dbt resources.

    от dbt-labs · MCP-сервер

    Опубликован: PyPI (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

Есть на витрине npm registry (MCP servers) (5)

  • protein-mcp-server io.github.cyanheads/protein-mcp-server

    Federated protein structure & annotation across experimental (PDB) and predicted (AlphaFold) models.

    от cyanheads · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, npm registry (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

  • uniprot-mcp-server io.github.cyanheads/uniprot-mcp-server

    Protein research over UniProtKB: search by function, fetch curated records, map IDs, proteomes.

    от cyanheads · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, npm registry (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

  • pubchem-mcp-server io.github.cyanheads/pubchem-mcp-server

    Search PubChem compounds, properties, safety data, bioactivity, and cross-references.

    от cyanheads · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, npm registry (MCP servers) · Решает похожую задачу

  • BioMCP-TS

    Biomedical MCP server: genes, variants, trials, literature, patents, optional SQL/R/biowasm tools.

    от yeyuan98 · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, npm registry (MCP servers) · Решает похожую задачу

  • chembl-mcp-server io.github.cyanheads/chembl-mcp-server

    Link compounds to protein targets, rank bioactivity, and look up drug mechanisms and indications.

    от cyanheads · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, npm registry (MCP servers) · Решает похожую задачу

Найдено по смыслу, а не по общему коду или репозиторию: похожие плагины остаются разными продуктами, и это не обзор и не рекомендация.

Хотите такой знак у своего плагина в нашем каталоге?

Докажите, что поддерживаете его, файлом в репозитории, файлом на вашем домене или DNS-записью, и сможете показать этот знак на карточке, а ещё живые баннеры для сайта и README. Как проходит подтверждение

Ещё вы будете получать уведомления, когда витрина добавит плагин, снимет его, изменит отметку verified или список того, что он просит, а его удалённый endpoint встанет на мониторинг как веб-сервис.

Добавить в свои проекты Что умеет панель

Данные витрины Official MCP Registry. Числа взяты из наших регулярных обходов витрин, последняя проверка . Контакты издателей плагинов мы не публикуем.

Откуда данные: как устроен каталог