Ext Ops Panel
Ouvrir le tableau de bord

io.github.mrfentmen/pdb-mcp

RCSB PDB: search 230k+ structures, read chains, ligands, formulas and citations — keyless.

Serveur MCP · par mrfentmen

Aperçu

io.github.mrfentmen/pdb-mcp est un serveur MCP publié par mrfentmen. Places de marché que nous lisons et qui le référencent : 1 (Official MCP Registry). Nous l'avons vu pour la première fois le 2026-10-27 et n'avons enregistré aucun changement depuis. Selon notre passage sur les places de marché du 2026-11-06.

Ce qu'il demande

  • S'exécute sur votre machine

Aucune des places de marché que nous lisons ne publie ses outils ni les réglages qu'il demande.

Ce qu'il déclare, demande et exécute, en détail

N’installez que des plugins de développeurs en qui vous avez confiance. Nous reprenons ce que publient les places de marché et ne testons pas les plugins.

Fonctionne avec

  • Claude Code
  • Codex
  • Cursor
  • VS Code
  • Copilot CLI

Un lien en un clic ouvre le client, qui demande une confirmation avant d'ajouter le serveur.

D'après les marketplaces qui le listent et le transport MCP qu'il déclare, tels que chaque client les documente. Nous ne testons pas les plugins.

Connecter

Commandes et configurations construites uniquement à partir de ce que déclarent ses places de marché. Nous ne les exécutons pas pour vous et ne testons pas les plugins.

En serveur MCP local : paquet npm

Construit à partir de ce que déclare Official MCP Registry.

Claude CodeTerminal
claude mcp add --transport stdio pdb-mcp -- npx -y pdb-mcp
Codex~/.codex/config.toml
[mcp_servers.pdb-mcp]
command = "npx"
args = ["-y", "pdb-mcp"]
Cursor~/.cursor/mcp.json
{
  "mcpServers": {
    "pdb-mcp": {
      "command": "npx",
      "args": [
        "-y",
        "pdb-mcp"
      ]
    }
  }
}

Où il est publié

Place de marchéStatutVersionChiffresVérifiéVu pour la première fois
Official MCP Registry (Ouvrir la fiche du registre) Référencé 1.0.0 Forks (GitHub): 0
Étoiles (GitHub): 0
Non marqué

Chaque chiffre est celui de la place de marché et n'est jamais additionné entre places de marché. Une place de marché qui ne publie pas de chiffre n'en affiche aucun : pas de nombre ne veut pas dire zéro.

Ce qui a changé

  1. Est devenu un produit que nous suivons
  2. Official MCP Registry: apparu

Plugins similaires

Produits dont les noms, descriptions, outils et skills sont les plus proches de celui-ci par le sens, sur toutes les places de marché que nous lisons. La proximité n'est classée qu'à l'intérieur de cette liste.

  • RCSB PDB

    MCP server to search, inspect, and cross-reference RCSB Protein Data Bank structures

    par rcsb · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry · Décrit presque le même besoin

  • protein-mcp-server io.github.cyanheads/protein-mcp-server

    Federated protein structure & annotation across experimental (PDB) and predicted (AlphaFold) models.

    par cyanheads · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, npm registry (MCP servers) · Décrit presque le même besoin

  • uniprot-mcp-server io.github.cyanheads/uniprot-mcp-server

    Protein research over UniProtKB: search by function, fetch curated records, map IDs, proteomes.

    par cyanheads · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, npm registry (MCP servers) · Décrit presque le même besoin

  • rcsb-pdb-mcp io.github.mrfentmen/rcsb-pdb-mcp

    Look up protein structures and search the RCSB Protein Data Bank. No key required.

    par mrfentmen · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry · Décrit un besoin similaire

  • ebi-search-mcp io.github.mrfentmen/ebi-search-mcp

    EBI Search API: search EMBL-EBI biomedical databases.

    par mrfentmen · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry · Décrit un besoin similaire

  • Pubchem

    PubChem MCP — NIH chemistry compound database (no auth)

    par pipeworx-io · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry · Décrit un besoin similaire

  • interpro-mcp-server io.github.cyanheads/interpro-mcp-server

    Search InterPro entries, map domains onto proteins and PDB structures, and scan raw sequences.

    par cyanheads · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry · Décrit un besoin similaire

  • Rcsb Pdb

    RCSB PDB MCP — experimentally determined macromolecular structures.

    par pipeworx-io · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry · Décrit un besoin similaire

  • alphafold-mcp io.github.mrfentmen/alphafold-mcp

    Keyless MCP server for AlphaFold: protein structure predictions by UniProt accession, confidence...

    par mrfentmen · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry · Décrit un besoin similaire

  • emdb-mcp io.github.mrfentmen/emdb-mcp

    EBI Electron Microscopy Data Bank: search cryo-EM maps and read resolution and method

    par mrfentmen · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry · Décrit un besoin similaire

Plugins similaires par place de marché

La même question posée à chaque place de marché séparément : y a-t-il là un équivalent de ce plugin ?

Référencé sur Claude Code: claude-plugins-community (5)
  • Gnosis MCP

    Zero-config MCP server for searchable documentation. SQLite or PostgreSQL.

    par nicholasglazer · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, Claude Code: claude-plugins-community, PyPI (MCP servers) · Décrit presque le même besoin

  • mdk-mcp-server io.github.SAP/mdk-mcp-server

    Model Context Protocol (MCP) server for AI-assisted development of MDK applications.

    par SAP · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, Claude Code: claude-plugins-official, Claude Code: claude-plugins-community · Décrit presque le même besoin

  • nodebench io.github.HomenShum/nodebench

    260 MCP tools across 49 domains. AI Flywheel, quality gates, research, web scraping.

    par HomenShum · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, Claude Code: claude-plugins-community · Décrit presque le même besoin

  • mcp-server io.github.cap-js/mcp-server

    Model Context Protocol (MCP) server for AI-assisted development of CAP applications.

    par cap-js · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, Claude Code: claude-plugins-official, Claude Code: claude-plugins-community · Décrit presque le même besoin

  • socraticode io.github.giancarloerra/socraticode

    MCP server for enterprise local codebase indexing, semantic search, and code dependency graphs.

    par giancarloerra · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, Claude Code: claude-plugins-community, Community GitHub marketplaces · Décrit presque le même besoin

Référencé sur Claude Code: claude-plugins-official (5)
  • mdk-mcp-server io.github.SAP/mdk-mcp-server

    Model Context Protocol (MCP) server for AI-assisted development of MDK applications.

    par SAP · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, Claude Code: claude-plugins-official, Claude Code: claude-plugins-community · Décrit presque le même besoin

  • mcp-server io.github.cap-js/mcp-server

    Model Context Protocol (MCP) server for AI-assisted development of CAP applications.

    par cap-js · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, Claude Code: claude-plugins-official, Claude Code: claude-plugins-community · Décrit presque le même besoin

  • mcp-server-dev

    Skills for designing and building MCP servers that work seamlessly with Claude. Guides you through deployment models (remote HTTP, MCPB, local), tool design patterns, auth, and…

    par Anthropic · Lot de plugins

    Référencé sur : Claude Code: claude-plugins-official · Décrit presque le même besoin

  • boltz

    Predict structures, screen molecules and proteins, and design binders with Boltz from Claude Code.

    par boltz-bio · Lot de plugins

    Référencé sur : Claude Code: claude-plugins-official, Claude Code: claude-plugins-community · Décrit presque le même besoin

  • Grafana

    An MCP server giving access to Grafana dashboards, data and more.

    par grafana · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, Claude Code: claude-plugins-official, Docker MCP Catalog, Claude Code: claude-plugins-community · Décrit presque le même besoin

Référencé sur Claude: knowledge-work-plugins (5)
  • figma

    Figma design platform integration. Access design files, extract component information, read design tokens, and translate designs into code. Bridge the gap between design and…

    par figma · Lot de plugins

    Référencé sur : Claude Code: claude-plugins-official, Official MCP Registry, Claude: knowledge-work-plugins, Copilot CLI: github/awesome-copilot · Décrit presque le même besoin

  • Desktop Commander

    MCP server for terminal commands, file operations, and process management

    par wonderwhy-er · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, Claude Code: claude-plugins-official, Docker MCP Catalog, Claude: knowledge-work-plugins, Claude Code: claude-plugins-community, Community GitHub marketplaces, npm registry (MCP servers) · Décrit presque le même besoin

  • Bio Research

    Connect to preclinical research tools and databases (literature search, genomics analysis, target prioritization) to accelerate early-stage life sciences R&D

    par Anthropic · Lot de plugins

    Référencé sur : Claude: knowledge-work-plugins · Décrit presque le même besoin

  • zoominfo

    Search companies and contacts, enrich leads, find lookalikes, and get AI-ranked contact recommendations. Pre-built skills chain multiple ZoomInfo tools into complete B2B sales…

    par Zoominfo · Lot de plugins

    Référencé sur : Claude Code: claude-plugins-official, Official MCP Registry, Claude: knowledge-work-plugins · Décrit presque le même besoin

  • planetscale

    An authenticated hosted MCP server that accesses your PlanetScale organizations, databases, branches, schema, and Insights data. Query against your data, surface slow queries, and…

    par planetscale · Lot de plugins

    Référencé sur : Claude Code: claude-plugins-official, Claude: knowledge-work-plugins, Claude Code: claude-plugins-community · Décrit presque le même besoin

Référencé sur Codex: openai-curated (openai/plugins) (5)
  • Boltz

    Predict structures, screen molecules and proteins, and design binders.

    par Boltz · Lot de plugins

    Référencé sur : Codex: openai-curated (openai/plugins) · Décrit presque le même besoin

  • Life Science Research

    General life-sciences research workflows with query routing, evidence synthesis, and optional parallel subagent analysis across genetics, omics, biology, chemistry, structure…

    par OpenAI · Lot de plugins

    Référencé sur : Codex: openai-curated (openai/plugins) · Décrit presque le même besoin

  • NVIDIA

    Skills for NVIDIAs ecosystem spans GPU acceleration, CUDA, AI agents, inference, robotics, Physical AI, Omniverse, and simulation. This plugin helps you understand the pieces…

    par NVIDIA · Lot de plugins

    Référencé sur : Codex: openai-curated (openai/plugins) · Décrit un besoin similaire

  • Consensus

    Consensus is the go-to MCP for academic research. Connect directly to 220M+ peer-reviewed papers to search, synthesize, and build structured research outputs from within your…

    par Consensus · Lot de plugins

    Référencé sur : Codex: openai-curated (openai/plugins) · Décrit un besoin similaire

  • MagicPath

    Use MagicPath to find, inspect, install, create, and edit UI components from Codex.

    par MagicPathAI · Lot de plugins

    Référencé sur : Codex: openai-curated (openai/plugins) · Décrit un besoin similaire

Référencé sur Community GitHub marketplaces (5)
  • arxiv-mcp-server io.github.blazickjp/arxiv-mcp-server

    Search arXiv papers, download full text, semantic search, citation graphs, and alerts via MCP.

    par blazickjp · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, PyPI (MCP servers), Community GitHub marketplaces · Décrit presque le même besoin

  • tooluniverse io.github.mims-harvard/tooluniverse

    2,700+ scientific tools for AI scientists: life science, research, literature, and more.

    par mims-harvard · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, Community GitHub marketplaces · Décrit presque le même besoin

  • biomcp

    Read-only biomedical search and evidence retrieval across BioMCP's CLI command grammar (genes, variants, trials, articles, drugs, diseases, pathways, proteins, and more). Wires…

    par GenomOncology · Lot de plugins

    Référencé sur : Community GitHub marketplaces · Décrit presque le même besoin

  • jDataMunch MCP

    Tabular data retrieval. Index CSV/Excel, query rows, aggregate. 99%+ savings vs raw file reads.

    par jgravelle · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, PyPI (MCP servers), Community GitHub marketplaces · Décrit presque le même besoin

  • socraticode io.github.giancarloerra/socraticode

    MCP server for enterprise local codebase indexing, semantic search, and code dependency graphs.

    par giancarloerra · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, Claude Code: claude-plugins-community, Community GitHub marketplaces · Décrit presque le même besoin

Référencé sur Copilot CLI: github/awesome-copilot (5)
  • go-mcp-development

    Complete toolkit for building Model Context Protocol (MCP) servers in Go using the official github.com/modelcontextprotocol/go-sdk. Includes instructions for best practices, a…

    par Awesome Copilot Community · Lot de plugins

    Référencé sur : Copilot CLI: github/awesome-copilot · Décrit presque le même besoin

  • typescript-mcp-development

    Complete toolkit for building Model Context Protocol (MCP) servers in TypeScript/Node.js using the official SDK. Includes instructions for best practices, a prompt for generating…

    par Awesome Copilot Community · Lot de plugins

    Référencé sur : Copilot CLI: github/awesome-copilot · Décrit presque le même besoin

  • TimeBase

    Explore and query TimeBase streams, schemas, QQL, symbols, and server status via MCP.

    par epam · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, Copilot CLI: github/awesome-copilot, PyPI (MCP servers) · Décrit presque le même besoin

  • kotlin-mcp-development

    Complete toolkit for building Model Context Protocol (MCP) servers in Kotlin using the official io.modelcontextprotocol:kotlin-sdk library. Includes instructions for best…

    par Awesome Copilot Community · Lot de plugins

    Référencé sur : Copilot CLI: github/awesome-copilot · Décrit presque le même besoin

  • php-mcp-development

    Comprehensive resources for building Model Context Protocol servers using the official PHP SDK with attribute-based discovery, including best practices, project generation, and…

    par Awesome Copilot Community · Lot de plugins

    Référencé sur : Copilot CLI: github/awesome-copilot · Décrit presque le même besoin

Référencé sur Copilot CLI: github/copilot-plugins (5)
  • mcp-apps

    Generate MCP App widgets for MCP tools. Produces self-contained HTML widgets using the MCP Apps protocol.

    par microsoft · Lot de plugins

    Référencé sur : Copilot CLI: github/copilot-plugins · Décrit presque le même besoin

  • canvas-apps

    Build Power Apps Canvas Apps using the Canvas Authoring MCP server.

    par microsoft · Lot de plugins

    Référencé sur : Copilot CLI: github/copilot-plugins · Décrit presque le même besoin

  • model-apps

    Build and deploy Power Apps generative pages for model-driven apps with specialist agents for planning, entity creation, and parallel code generation. Requires PAC CLI >= 2.7.0…

    par microsoft · Lot de plugins

    Référencé sur : Copilot CLI: github/copilot-plugins · Décrit presque le même besoin

  • cpp-language-server

    Navigate and interact with your C++ code using the Microsoft C++ Language Server.

    par microsoft · Lot de plugins

    Référencé sur : Copilot CLI: github/copilot-plugins · Décrit presque le même besoin

  • microsoft-365-agents-toolkit

    Toolkit for building Microsoft 365 Copilot declarative agents — scaffolding, JSON manifest development, and capability configuration.

    par microsoft · Lot de plugins

    Référencé sur : Copilot CLI: github/copilot-plugins · Décrit un besoin similaire

Référencé sur Cursor: cursor/plugins (5)
  • Tailscale

    Let Grok Bot reach MCP servers on your private Tailscale network: connect your own tailnet, or your team's company tailnets turned on by a team admin, with each member using their…

    par Cursor · Lot de plugins

    Référencé sur : Cursor: cursor/plugins · Décrit presque le même besoin

  • Cursor SDK

    Build apps, scripts, and automations with the TypeScript SDK.

    par Cursor · Lot de plugins

    Référencé sur : Cursor: cursor/plugins · Décrit presque le même besoin

  • Agent Compatibility

    CLI-backed repo compatibility scans plus agents that audit startup, validation, and docs against reality.

    par Cursor · Lot de plugins

    Référencé sur : Cursor: cursor/plugins · Décrit presque le même besoin

  • Power BI

    Browse Microsoft Power BI workspaces and render report pages.

    par Cursor · Lot de plugins

    Référencé sur : Cursor: cursor/plugins · Décrit presque le même besoin

  • playwright-mcp io.github.microsoft/playwright-mcp

    Playwright Tools for MCP

    par microsoft · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, Claude Code: claude-plugins-official, Cursor: cursor/plugins, Docker MCP Catalog, Community GitHub marketplaces · Décrit presque le même besoin

Référencé sur Docker MCP Catalog (5)
  • Rube

    Access to Rube's catalog of remote MCP servers.

    par docker · Serveur MCP

    Référencé sur : Docker MCP Catalog · Décrit presque le même besoin

  • Git (Reference)

    Git repository interaction and automation.

    par modelcontextprotocol · Serveur MCP

    Référencé sur : Docker MCP Catalog, PyPI (MCP servers) · Décrit presque le même besoin

  • Kagi Search

    The Official Model Context Protocol (MCP) server for Kagi Search & other tools.

    par kagisearch · Serveur MCP

    Référencé sur : Docker MCP Catalog · Décrit presque le même besoin

  • npm-sentinel-mcp io.github.Nekzus/npm-sentinel-mcp

    Advanced NPM analysis: Recursive security scanning, ecosystem awareness, and deep insights.

    par Nekzus · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, Docker MCP Catalog, npm registry (MCP servers) · Décrit presque le même besoin

  • Firecrawl MCP Server

    Firecrawl, the context API for AI agents: search, scrape, interact with the web, plus paper search.

    par firecrawl · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, Docker MCP Catalog, Community GitHub marketplaces · Décrit presque le même besoin

Référencé sur Official MCP Registry (5)
  • RCSB PDB

    MCP server to search, inspect, and cross-reference RCSB Protein Data Bank structures

    par rcsb · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry · Décrit presque le même besoin

  • protein-mcp-server io.github.cyanheads/protein-mcp-server

    Federated protein structure & annotation across experimental (PDB) and predicted (AlphaFold) models.

    par cyanheads · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, npm registry (MCP servers) · Décrit presque le même besoin

  • uniprot-mcp-server io.github.cyanheads/uniprot-mcp-server

    Protein research over UniProtKB: search by function, fetch curated records, map IDs, proteomes.

    par cyanheads · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, npm registry (MCP servers) · Décrit presque le même besoin

  • rcsb-pdb-mcp io.github.mrfentmen/rcsb-pdb-mcp

    Look up protein structures and search the RCSB Protein Data Bank. No key required.

    par mrfentmen · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry · Décrit un besoin similaire

  • ebi-search-mcp io.github.mrfentmen/ebi-search-mcp

    EBI Search API: search EMBL-EBI biomedical databases.

    par mrfentmen · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry · Décrit un besoin similaire

Référencé sur PyPI (MCP servers) (5)
  • AlphaFold Sovereign MCP

    MCP server for AlphaFold and 8 other biomedical data sources with a local SQLite knowledge graph

    par smaniches · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, PyPI (MCP servers) · Décrit presque le même besoin

  • UniProt MCP

    Verifiable, release-aware protein evidence workflows over UniProt and linked scientific sources.

    par smaniches · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, PyPI (MCP servers) · Décrit presque le même besoin

  • ChemDraw MCP (unofficial)

    Molecule names or SMILES to 2D structures, reactions, mechanisms, spectra - offline via RDKit.

    par jurimaxam-dotcom · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, PyPI (MCP servers) · Décrit presque le même besoin

  • arxiv-mcp-server io.github.blazickjp/arxiv-mcp-server

    Search arXiv papers, download full text, semantic search, citation graphs, and alerts via MCP.

    par blazickjp · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, PyPI (MCP servers), Community GitHub marketplaces · Décrit presque le même besoin

  • dbt-mcp

    A MCP (Model Context Protocol) server for interacting with dbt resources.

    par dbt-labs · Serveur MCP

    Référencé sur : PyPI (MCP servers) · Décrit presque le même besoin

Référencé sur npm registry (MCP servers) (5)
  • protein-mcp-server io.github.cyanheads/protein-mcp-server

    Federated protein structure & annotation across experimental (PDB) and predicted (AlphaFold) models.

    par cyanheads · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, npm registry (MCP servers) · Décrit presque le même besoin

  • uniprot-mcp-server io.github.cyanheads/uniprot-mcp-server

    Protein research over UniProtKB: search by function, fetch curated records, map IDs, proteomes.

    par cyanheads · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, npm registry (MCP servers) · Décrit presque le même besoin

  • pubchem-mcp-server io.github.cyanheads/pubchem-mcp-server

    Search PubChem compounds, properties, safety data, bioactivity, and cross-references.

    par cyanheads · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, npm registry (MCP servers) · Décrit un besoin similaire

  • BioMCP-TS

    Biomedical MCP server: genes, variants, trials, literature, patents, optional SQL/R/biowasm tools.

    par yeyuan98 · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, npm registry (MCP servers) · Décrit un besoin similaire

  • chembl-mcp-server io.github.cyanheads/chembl-mcp-server

    Link compounds to protein targets, rank bioactivity, and look up drug mechanisms and indications.

    par cyanheads · Serveur MCP

    Référencé sur : Official MCP Registry, npm registry (MCP servers) · Décrit un besoin similaire

Trouvés par le sens, et non par un code ou un dépôt commun : les plugins similaires restent des produits distincts, et ceci n'est ni un avis ni une recommandation.

Vous voulez cette marque pour votre plugin dans notre catalogue ?

Prouvez que vous le maintenez avec un fichier dans son dépôt, un fichier sur votre domaine ou un enregistrement DNS, et vous pourrez afficher cette marque sur la fiche, avec des bannières à jour pour votre site et votre README. Comment se passe la vérification

Vous recevez aussi des alertes quand une marketplace le publie, le retire, change sa marque vérifiée ou ce qu'il demande, et son endpoint distant est surveillé comme un service web.

Données issues de Official MCP Registry. Les chiffres proviennent de nos propres passages réguliers sur les places de marché, dernière lecture le . Nous ne publions aucune coordonnée des éditeurs de plugins.

D’où viennent les données : comment le catalogue est construit