Ext Ops Panel
Открыть панель

BioMapper

Resolve metabolite, lipid, protein, gene and lab names to knowledge-graph IDs.

MCP-сервер · от trentleslie

Коротко

BioMapper: MCP-сервер, издатель trentleslie. Витрин, которые мы читаем и где он опубликован: 1 (Official MCP Registry). Мы впервые увидели его 2026-11-04 и с тех пор изменений не фиксировали. Данные нашего прохода по витринам на 2026-11-06.

Что просит

  • Работает на вашем компьютере
  • Секретов: 1
  • Настроек: 4

Требует: BIOMAPPER_API_KEY (секрет)

Что объявляет, просит и запускает, полностью

Устанавливайте плагины только от разработчиков, которым доверяете. Мы показываем то, что публикуют витрины, и не проверяем плагины.

Работает с

  • Claude Code
  • Codex
  • Cursor
  • VS Code
  • Copilot CLI

По маркетплейсам, где он опубликован, и объявленному транспорту MCP, как их документирует каждый клиент. Плагины мы не тестируем.

Подключить

Команды и конфигурации собраны только из того, что объявляют витрины. Мы не запускаем их за вас и не проверяем плагины.

Как локальный MCP-сервер: пакет PyPI

Собрано из того, что объявляет Official MCP Registry.

Claude CodeТерминал
claude mcp add --env "BIOMAPPER_API_KEY=<YOUR_BIOMAPPER_API_KEY>" --transport stdio biomapper -- uvx biomapper
Codex~/.codex/config.toml
[mcp_servers.biomapper]
command = "uvx"
args = ["biomapper"]

[mcp_servers.biomapper.env]
BIOMAPPER_API_KEY = "<YOUR_BIOMAPPER_API_KEY>"
Cursor~/.cursor/mcp.json
{
  "mcpServers": {
    "biomapper": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "biomapper"
      ],
      "env": {
        "BIOMAPPER_API_KEY": "<YOUR_BIOMAPPER_API_KEY>"
      }
    }
  }
}

Замените значения в угловых скобках своими. Мы показываем имена настроек, но не значения.

Необязательные настройки, которые он тоже перечисляет: BIOMAPPER_BASE_URL, BIOMAPPER_MCP_HOME, BIOMAPPER_MCP_ROOTS.

Где опубликован

ВитринаСтатусВерсияЧислаПроверенВпервые замечен
Official MCP Registry (Открыть запись реестра) Опубликован 1.6.2 Форки (GitHub): 0
Звёзды (GitHub): 0
Не помечен

Каждое число принадлежит своей витрине и никогда не складывается с числами других витрин. Если витрина число не публикует, мы его не показываем: нет числа не значит ноль.

Что менялось

  1. Стал продуктом, за которым мы следим
  2. Official MCP Registry: появился

Похожие плагины

Продукты, чьи собственные названия, описания, инструменты и скиллы ближе всего по смыслу к этому, на всех витринах, которые мы читаем. Близость упорядочена только внутри этого списка.

  • kegg-mcp-server

    Query the KEGG bioinformatics database — pathways, genes, compounds, drugs, enzymes, diseases, reactions, and more via 34 read-only MCP tools. No API key required.

    от Lucas Servi · Пакет плагинов

    Опубликован: Community GitHub marketplaces · Решает почти ту же задачу

  • STRING Database MCP Server

    Query STRING interactions, enrichment, annotations, homology, and PPI networks.

    от string-db.org · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry · Решает почти ту же задачу

  • metabolights-mcp io.github.mrfentmen/metabolights-mcp

    EBI MetaboLights: search public metabolomics studies and read study detail and organisms

    от mrfentmen · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry · Решает почти ту же задачу

  • Life Science Research

    General life-sciences research workflows with query routing, evidence synthesis, and optional parallel subagent analysis across genetics, omics, biology, chemistry, structure…

    от OpenAI · Пакет плагинов

    Опубликован: Codex: openai-curated (openai/plugins) · Решает почти ту же задачу

  • UniBio Intelligence

    Connect AI clients to biomedical data and tools.

    от unibio-intelligence · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry · Решает почти ту же задачу

  • UK Data: Protein data (UniProt)

    UniProt protein data: find proteins, map genes to proteins, function and disease links

    от reliness.co.uk · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry · Решает почти ту же задачу

  • kegg-mcp io.github.mrfentmen/kegg-mcp

    Search KEGG genes and compounds, read entries and list their pathways - keyless.

    от mrfentmen · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry · Решает почти ту же задачу

  • Naturepedia Canonical Discovery

    Search and resolve Naturepedia, Robbie's Razor, and GC-MRD-v2.0 canonical resources.

    от robbiegeorgephotography.com · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry · Решает почти ту же задачу

  • chembl-mcp io.github.mrfentmen/chembl-mcp

    Drug molecules and bioactivity from the ChEMBL database. No key required.

    от mrfentmen · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry · Решает почти ту же задачу

  • tooluniverse io.github.mims-harvard/tooluniverse

    2,700+ scientific tools for AI scientists: life science, research, literature, and more.

    от mims-harvard · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, Community GitHub marketplaces · Решает почти ту же задачу

Похожие плагины по витринам

Тот же вопрос к каждой витрине по отдельности: есть ли там аналог этого плагина?

Есть на витрине Claude Code: claude-plugins-community (5)
  • sciagent-skills

    197 ready-to-use life sciences skills that turn Claude into a domain expert for genomics, proteomics, drug discovery, biostatistics, scientific computing, and scientific writing…

    от jaechang-hits · Пакет плагинов

    Опубликован: Claude Code: claude-plugins-community, Community GitHub marketplaces · Решает почти ту же задачу

  • boltz

    Predict structures, screen molecules and proteins, and design binders with Boltz from Claude Code.

    от boltz-bio · Пакет плагинов

    Опубликован: Claude Code: claude-plugins-official, Claude Code: claude-plugins-community · Решает почти ту же задачу

  • compact-knowledge-graph-ckg

    Build and query Compact Knowledge Graphs directly in Claude Code. Includes a skill to convert any CSV into a CKG and an MCP server with 8 pre-built domains. 42x more efficient…

    от Yarmoluk · Пакет плагинов

    Опубликован: Claude Code: claude-plugins-community · Решает почти ту же задачу

  • nagomi

    Forensic-grade PubMed research engine for Claude Code. Search 36M+ biomedical articles with PICO-structured queries, synthesize evidence with GRADE confidence ratings, critically…

    от avivlyweb · Пакет плагинов

    Опубликован: Claude Code: claude-plugins-community · Решает почти ту же задачу

  • msds-chain io.github.littleblakew/msds-chain

    Chemical safety intelligence — 25 tools: compatibility, hazards, PPE, compliance, SDS lookup

    от littleblakew · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, Claude Code: claude-plugins-community · Решает похожую задачу

Есть на витрине Claude Code: claude-plugins-official (5)
  • boltz

    Predict structures, screen molecules and proteins, and design binders with Boltz from Claude Code.

    от boltz-bio · Пакет плагинов

    Опубликован: Claude Code: claude-plugins-official, Claude Code: claude-plugins-community · Решает почти ту же задачу

  • pigment

    Analyze business data and build custom Pigment models, metrics, and boards through natural language.

    от gopigment · Пакет плагинов

    Опубликован: Claude Code: claude-plugins-official, Claude Code: claude-plugins-community · Решает похожую задачу

  • alloydb

    Create, connect, and interact with an AlloyDB for PostgreSQL database and data.

    от gemini-cli-extensions · Пакет плагинов

    Опубликован: Claude Code: claude-plugins-official, Claude Code: claude-plugins-community, Community GitHub marketplaces · Решает похожую задачу

  • atlan

    Atlan data catalog plugin for Claude Code. Search, explore, govern, and manage your data assets through natural language. Powered by the Atlan MCP server with semantic search…

    от atlanhq · Пакет плагинов

    Опубликован: Claude Code: claude-plugins-official, Claude: knowledge-work-plugins, Claude Code: claude-plugins-community, Community GitHub marketplaces · Решает похожую задачу

  • informatica-for-claude-platform

    Governed catalog discovery for Informatica Intelligent Data Management Cloud (CDGC): find tables, columns, files, glossary terms and policies across the enterprise catalog, check…

    от forcedotcom · Пакет плагинов

    Опубликован: Claude Code: claude-plugins-official, Claude: knowledge-work-plugins · Решает похожую задачу

Есть на витрине Claude: knowledge-work-plugins (5)
  • Bio Research

    Connect to preclinical research tools and databases (literature search, genomics analysis, target prioritization) to accelerate early-stage life sciences R&D

    от Anthropic · Пакет плагинов

    Опубликован: Claude: knowledge-work-plugins · Решает почти ту же задачу

  • Maven Bio

    Evidence-backed BioPharma research workflows over Maven Bio's drug, trial, company, and deal knowledge graph. Skills for competitive pipelines, indication landscapes, asset…

    от MavenBio · Пакет плагинов

    Опубликован: Claude: knowledge-work-plugins · Решает почти ту же задачу

  • langfuse

    Skills for working with Langfuse, the open-source LLM engineering platform for tracing, prompt management, and evaluation.

    от langfuse · Пакет плагинов

    Опубликован: Claude Code: claude-plugins-official, Claude: knowledge-work-plugins, Claude Code: claude-plugins-community · Решает похожую задачу

  • atlan

    Atlan data catalog plugin for Claude Code. Search, explore, govern, and manage your data assets through natural language. Powered by the Atlan MCP server with semantic search…

    от atlanhq · Пакет плагинов

    Опубликован: Claude Code: claude-plugins-official, Claude: knowledge-work-plugins, Claude Code: claude-plugins-community, Community GitHub marketplaces · Решает смежную задачу

  • informatica-for-claude-platform

    Governed catalog discovery for Informatica Intelligent Data Management Cloud (CDGC): find tables, columns, files, glossary terms and policies across the enterprise catalog, check…

    от forcedotcom · Пакет плагинов

    Опубликован: Claude Code: claude-plugins-official, Claude: knowledge-work-plugins · Решает смежную задачу

Есть на витрине Codex: openai-curated (openai/plugins) (5)
  • Life Science Research

    General life-sciences research workflows with query routing, evidence synthesis, and optional parallel subagent analysis across genetics, omics, biology, chemistry, structure…

    от OpenAI · Пакет плагинов

    Опубликован: Codex: openai-curated (openai/plugins) · Решает почти ту же задачу

  • Boltz

    Predict structures, screen molecules and proteins, and design binders.

    от Boltz · Пакет плагинов

    Опубликован: Codex: openai-curated (openai/plugins) · Решает почти ту же задачу

  • Life Sciences NGS Analysis

    Guided NGS intake, local execution, and public-pipeline routing for BCL, FASTQ, DNA variant, RNA-seq, single-cell, epigenomics, amplicon, and metagenomics analyses, with deeper…

    от OpenAI · Пакет плагинов

    Опубликован: Codex: openai-curated (openai/plugins) · Решает похожую задачу

  • MagicPath

    Use MagicPath to find, inspect, install, create, and edit UI components from Codex.

    от MagicPathAI · Пакет плагинов

    Опубликован: Codex: openai-curated (openai/plugins) · Решает смежную задачу

  • Plugin Eval

    Evaluate Codex skills and plugins from chat with a beginner-friendly start command, local-first reports, token budget explanations, and guided benchmarking.

    от OpenAI Codex · Пакет плагинов

    Опубликован: Codex: openai-curated (openai/plugins) · Решает смежную задачу

Есть на витрине Community GitHub marketplaces (5)
  • kegg-mcp-server

    Query the KEGG bioinformatics database — pathways, genes, compounds, drugs, enzymes, diseases, reactions, and more via 34 read-only MCP tools. No API key required.

    от Lucas Servi · Пакет плагинов

    Опубликован: Community GitHub marketplaces · Решает почти ту же задачу

  • tooluniverse io.github.mims-harvard/tooluniverse

    2,700+ scientific tools for AI scientists: life science, research, literature, and more.

    от mims-harvard · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, Community GitHub marketplaces · Решает почти ту же задачу

  • sciagent-skills

    197 ready-to-use life sciences skills that turn Claude into a domain expert for genomics, proteomics, drug discovery, biostatistics, scientific computing, and scientific writing…

    от jaechang-hits · Пакет плагинов

    Опубликован: Claude Code: claude-plugins-community, Community GitHub marketplaces · Решает почти ту же задачу

  • scientific-databases

    Programmatic access to public scientific databases and APIs.

    от Kalaris Labs · Пакет плагинов

    Опубликован: Community GitHub marketplaces · Решает почти ту же задачу

  • chemistry-research

    Cheminformatics, molecular modelling and research reporting.

    от Kalaris Labs · Пакет плагинов

    Опубликован: Community GitHub marketplaces · Решает почти ту же задачу

Есть на витрине Copilot CLI: github/awesome-copilot (5)
  • BLEA

    Safe BLE diagnostics, evidence workflows, and guarded automation for AI agents.

    от Nitmi · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, Copilot CLI: github/awesome-copilot · Решает почти ту же задачу

  • doublecheck

    Three-layer verification pipeline for AI output. Extracts claims, finds sources, and flags hallucination risks so humans can verify before acting.

    от Awesome Copilot Community · Пакет плагинов

    Опубликован: Copilot CLI: github/awesome-copilot · Решает почти ту же задачу

  • token-pacman

    Visualizes live session AI-credit usage as a Pac-Man board with pellets, ghosts, fruit milestones, and game-over limits.

    от James Montemagno · Пакет плагинов

    Опубликован: Copilot CLI: github/awesome-copilot · Решает почти ту же задачу

  • TimeBase

    Explore and query TimeBase streams, schemas, QQL, symbols, and server status via MCP.

    от epam · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, Copilot CLI: github/awesome-copilot, PyPI (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

  • chronicle-stats

    See your local Copilot token usage by day, model, and session, and get tips to use it more efficiently.

    от Julia Muiruri · Пакет плагинов

    Опубликован: Copilot CLI: github/awesome-copilot · Решает почти ту же задачу

Есть на витрине Copilot CLI: github/copilot-plugins (5)
  • workiq

    Query Microsoft 365 data with natural language — emails, meetings, documents, Teams messages, and more.

    от microsoft · Пакет плагинов

    Опубликован: Copilot CLI: github/copilot-plugins, npm registry (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

  • microsoft-365-agents-toolkit

    Toolkit for building Microsoft 365 Copilot declarative agents — scaffolding, JSON manifest development, and capability configuration.

    от microsoft · Пакет плагинов

    Опубликован: Copilot CLI: github/copilot-plugins · Решает почти ту же задачу

  • canvas-apps

    Build Power Apps Canvas Apps using the Canvas Authoring MCP server.

    от microsoft · Пакет плагинов

    Опубликован: Copilot CLI: github/copilot-plugins · Решает почти ту же задачу

  • model-apps

    Build and deploy Power Apps generative pages for model-driven apps with specialist agents for planning, entity creation, and parallel code generation. Requires PAC CLI >= 2.7.0…

    от microsoft · Пакет плагинов

    Опубликован: Copilot CLI: github/copilot-plugins · Решает почти ту же задачу

  • mcp-apps

    Generate MCP App widgets for MCP tools. Produces self-contained HTML widgets using the MCP Apps protocol.

    от microsoft · Пакет плагинов

    Опубликован: Copilot CLI: github/copilot-plugins · Решает почти ту же задачу

Есть на витрине Cursor: cursor/plugins (5)
  • Clay

    Enrich people and companies, run AI research agents.

    от Cursor · Пакет плагинов

    Опубликован: Cursor: cursor/plugins · Решает почти ту же задачу

  • Databricks Genie One

    Ask Databricks Genie questions about your workspace's data in plain language.

    от Cursor · Пакет плагинов

    Опубликован: Cursor: cursor/plugins · Решает почти ту же задачу

  • PostHog MCP

    Work with PostHog from chat: query product analytics and run SQL, manage feature flags and experiments, triage error tracking issues, and review session replays, surveys, and…

    от Cursor · Пакет плагинов

    Опубликован: Cursor: cursor/plugins · Решает почти ту же задачу

  • Google Cloud BigQuery

    Explore datasets and tables and run SQL queries.

    от Cursor · Пакет плагинов

    Опубликован: Cursor: cursor/plugins · Решает почти ту же задачу

  • Ralph Loop

    Iterative self-referential AI loops using the Ralph Wiggum technique.

    от Cursor · Пакет плагинов

    Опубликован: Cursor: cursor/plugins · Решает почти ту же задачу

Есть на витрине Docker MCP Catalog (5)
  • Memory (Reference)

    Knowledge graph-based persistent memory system.

    от modelcontextprotocol · MCP-сервер

    Опубликован: Docker MCP Catalog · Решает почти ту же задачу

  • Kagi Search

    The Official Model Context Protocol (MCP) server for Kagi Search & other tools.

    от kagisearch · MCP-сервер

    Опубликован: Docker MCP Catalog · Решает почти ту же задачу

  • AWS HealthOmics

    Generate, run, debug lifescience workflows.

    от awslabs · MCP-сервер

    Опубликован: Docker MCP Catalog · Решает почти ту же задачу

  • mcp-neo4j-memory io.github.neo4j-contrib/mcp-neo4j-memory

    MCP Neo4j Knowledge Graph Memory Server

    от neo4j-contrib · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, Docker MCP Catalog · Решает почти ту же задачу

  • mcp-neo4j-cypher io.github.neo4j-contrib/mcp-neo4j-cypher

    A simple Neo4j MCP server that allows you to run Cypher queries against a Neo4j database.

    от neo4j-contrib · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, Docker MCP Catalog · Решает почти ту же задачу

Есть на витрине Official MCP Registry (5)
  • STRING Database MCP Server

    Query STRING interactions, enrichment, annotations, homology, and PPI networks.

    от string-db.org · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry · Решает почти ту же задачу

  • metabolights-mcp io.github.mrfentmen/metabolights-mcp

    EBI MetaboLights: search public metabolomics studies and read study detail and organisms

    от mrfentmen · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry · Решает почти ту же задачу

  • UniBio Intelligence

    Connect AI clients to biomedical data and tools.

    от unibio-intelligence · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry · Решает почти ту же задачу

  • UK Data: Protein data (UniProt)

    UniProt protein data: find proteins, map genes to proteins, function and disease links

    от reliness.co.uk · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry · Решает почти ту же задачу

  • kegg-mcp io.github.mrfentmen/kegg-mcp

    Search KEGG genes and compounds, read entries and list their pathways - keyless.

    от mrfentmen · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry · Решает почти ту же задачу

Есть на витрине PyPI (MCP servers) (5)
  • opentargets io.github.nickzren/opentargets

    Read-only Open Targets: targets, diseases, drugs and evidence by name or ID. No API key needed.

    от nickzren · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, PyPI (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

  • AlphaFold Sovereign MCP

    MCP server for AlphaFold and 8 other biomedical data sources with a local SQLite knowledge graph

    от smaniches · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, PyPI (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

  • Data Aggregator

    Find & fetch research datasets across 21 archives, omics registries, and literature sources.

    от musharna · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, PyPI (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

  • phenoworks-mcp

    Connect AI assistants to PhenoWorks projects, datasets, and analysis pipelines through MCP.

    от OpenSciML · MCP-сервер

    Опубликован: PyPI (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

  • UniProt MCP

    Verifiable, release-aware protein evidence workflows over UniProt and linked scientific sources.

    от smaniches · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, PyPI (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

Есть на витрине npm registry (MCP servers) (5)
  • uniprot-mcp-server io.github.cyanheads/uniprot-mcp-server

    Protein research over UniProtKB: search by function, fetch curated records, map IDs, proteomes.

    от cyanheads · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, npm registry (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

  • chembl-mcp-server io.github.cyanheads/chembl-mcp-server

    Link compounds to protein targets, rank bioactivity, and look up drug mechanisms and indications.

    от cyanheads · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, npm registry (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

  • pubchem-mcp-server io.github.cyanheads/pubchem-mcp-server

    Search PubChem compounds, properties, safety data, bioactivity, and cross-references.

    от cyanheads · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, npm registry (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

  • pubcrawl io.github.nickjlamb/pubcrawl

    PubMed & Europe PMC literature search, US/UK drug labelling, and clinical trials for AI assistants.

    от nickjlamb · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, npm registry (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

  • protein-mcp-server io.github.cyanheads/protein-mcp-server

    Federated protein structure & annotation across experimental (PDB) and predicted (AlphaFold) models.

    от cyanheads · MCP-сервер

    Опубликован: Official MCP Registry, npm registry (MCP servers) · Решает почти ту же задачу

Найдено по смыслу, а не по общему коду или репозиторию: похожие плагины остаются разными продуктами, и это не обзор и не рекомендация.

Хотите такой знак у своего плагина в нашем каталоге?

Докажите, что поддерживаете его, файлом в репозитории, файлом на вашем домене или DNS-записью, и сможете показать этот знак на карточке, а ещё живые баннеры для сайта и README. Как проходит подтверждение

Ещё вы будете получать уведомления, когда витрина добавит плагин, снимет его, изменит отметку verified или список того, что он просит, а его удалённый endpoint встанет на мониторинг как веб-сервис.

Данные витрины Official MCP Registry. Числа взяты из наших регулярных обходов витрин, последняя проверка . Контакты издателей плагинов мы не публикуем.

Откуда данные: как устроен каталог