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io.github.cyanheads/ensembl-mcp-server

Look up genes, sequences, variants, homologs, and cross-database xrefs from Ensembl REST.

Serveur MCP · par cyanheads

Connecter Comparer Revendiquer

Aperçu

io.github.cyanheads/ensembl-mcp-server est un serveur MCP publié par cyanheads. Places de marché que nous lisons et qui le référencent : 1 (Official MCP Registry). Le dernier changement enregistré date du 2026-10-13. Selon notre passage sur les places de marché du 2026-10-14.

Ce qu'il demande

  • S'exécute à distance
  • Paramètres : 7

Ce qu'il déclare, demande et exécute, en détail

N’installez que des plugins de développeurs en qui vous avez confiance. Nous reprenons ce que publient les places de marché et ne testons pas les plugins.

Paquet

npm @cyanheads/ensembl-mcp-server (@cyanheads/ensembl-mcp-server sur npm)

  • Téléchargements npm par semaine: 314 (2026-10-12)
  • Téléchargements npm par mois: 1 015 (2026-10-12)
  • Dernière version sur npm : 0.5.1, publiée le 2026-10-08
  • La version déclarée 0.6.0 n'est pas listée sur npm

Les données npm proviennent du registre public npm (registry.npmjs.org, api.npmjs.org). Chaque chiffre est celui du registre et ne s'additionne jamais à un autre. Un registre qui ne publie pas de chiffre n'en affiche aucun : pas de chiffre ne veut pas dire zéro.

Fonctionne avec

  • Claude Code
  • Codex
  • Cursor
  • VS Code
  • Copilot CLI
Installer dans CursorInstaller dans VS Code

Un lien en un clic ouvre le client, qui demande une confirmation avant d'ajouter le serveur.

D'après les marketplaces qui le listent et le transport MCP qu'il déclare, tels que chaque client les documente. Nous ne testons pas les plugins.

Observé par Ext Ops

Observé par Ext Ops le 2026-10-13 : ce que l'endpoint lui-même a répondu quand on lui a demandé de lister ses outils. Nous n'appelons jamais les outils.

Outils : 7 · Ressources : 9 · Prompts : 1

Serveur : ensembl-mcp-server 0.6.0 · version du protocole MCP 2025-06-18

Métadonnées des outils selon la liste du 2026-10-13 : annotations sur 7 outils sur 7 · descriptions sur 35 paramètres sur 35.

  • ensembl_get_homologyFind orthologs and/or paralogs of a gene across species. Returns each homolog's stable ID, species, homology type (ortholog_one2one, ortholog_one2many, paralog_many2many, etc.), perc_id (percent iden…
  • ensembl_get_sequenceFetch the DNA, cDNA, CDS, or protein sequence for a gene, transcript, protein, or genomic region. Returns a window of the sequence — the first 10,000 characters by default — with its stable ID, molec…
  • ensembl_get_xrefsRetrieve cross-database references for a gene or feature — HGNC, UniProt, EntrezGene, OMIM, RefSeq, Reactome, and others. Returns each xref with its database name, primary ID, display ID, and descrip…
  • ensembl_list_speciesList species supported by Ensembl with display name, common name, assembly, taxon ID, and division. Required discovery step — species names like homo_sapiens are opaque to non-biologists and are the…
  • ensembl_lookup_geneResolve a gene by symbol + species (or by stable ID) to its Ensembl ID, genomic location (chr:start-end:strand), biotype, description, and transcript list. Entry point for most workflows — the stable…
  • ensembl_predict_variantPredict the functional consequences of a sequence variant using the Ensembl Variant Effect Predictor (VEP). Accepts three input formats: HGVS notation (transcript-relative, e.g. ENST00000380152.8:c.2…
  • ensembl_query_regionFind genomic features overlapping a chromosomal region: genes, transcripts, variants, regulatory elements, or exons. Returns each feature with its stable ID, type, location, biotype, and name, plus t…

Ses marketplaces ne publient pas de liste d'outils.

Comment nous vérifions les endpoints

Connecter

Commandes et configurations construites uniquement à partir de ce que déclarent ses places de marché. Nous ne les exécutons pas pour vous et ne testons pas les plugins.

En serveur MCP distant

Construit à partir de ce que déclare Official MCP Registry.

Claude CodeTerminal
claude mcp add --transport http ensembl-mcp-server https://ensembl.caseyjhand.com/mcp
Codex~/.codex/config.toml
[mcp_servers.ensembl-mcp-server]
url = "https://ensembl.caseyjhand.com/mcp"
Cursor~/.cursor/mcp.json
{
  "mcpServers": {
    "ensembl-mcp-server": {
      "url": "https://ensembl.caseyjhand.com/mcp"
    }
  }
}

Où il est publié

Place de marchéStatutVersionChiffresVérifiéVu pour la première fois
Official MCP Registry (Ouvrir la fiche du registre) Référencé 0.6.0 Téléchargements par mois (npm): 1 015
Téléchargements par semaine (npm): 314
Forks (GitHub): 0
Étoiles (GitHub): 3		 Non marqué

Chaque chiffre est celui de la place de marché et n'est jamais additionné entre places de marché. Une place de marché qui ne publie pas de chiffre n'en affiche aucun : pas de nombre ne veut pas dire zéro.

Ce qui a changé

  1. Official MCP Registry: version 0.6.0 publiée (avant 0.5.1)

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    par mrfentmen · Serveur MCP

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    par mrfentmen · Serveur MCP

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    Access to Rube's catalog of remote MCP servers.

    par docker · Serveur MCP

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Trouvés par le sens, et non par un code ou un dépôt commun : les plugins similaires restent des produits distincts, et ceci n'est ni un avis ni une recommandation.

C'est votre plugin ?

Ajoutez-le à vos projets et prouvez que vous le maintenez : un fichier dans son dépôt, un fichier sur votre domaine ou un enregistrement DNS. Vous recevez des alertes quand une marketplace le publie, le retire, change sa marque vérifiée ou ce qu'il demande, et son endpoint distant est surveillé comme un service web.

Ajouter à vos projets Découvrir le panneau

Données issues de Official MCP Registry. Les chiffres proviennent de nos propres passages réguliers sur les places de marché, dernière lecture le . Nous ne publions aucune coordonnée des éditeurs de plugins.

D’où viennent les données : comment le catalogue est construit