biotope vs. Kindex
biotope não está mais listado em nenhum marketplace que lemos: estes são os últimos dados conhecidos, de 2026‑10‑19.
biotope é um pacote de plugins para ferramentas de programação com IA publicado por BioCypher Team. Nenhum marketplace que lemos o lista mais. Kindex é um servidor MCP publicado por jmcentire. Marketplaces que lemos e que o listam: 2 (Official MCP Registry, Community GitHub marketplaces). Conforme nossa passagem pelos marketplaces em 2026-10-23. Um plugin deste par não está mais listado em nenhum marketplace que lemos, por isso pedimos aos buscadores que não indexem a página.
Onde cada um é publicado
| Marketplace |  Kindex | |
|---|---|---|
| Marketplace da comunidade biocypher/biotope | Removido em 2026-10-19 Versão: 0.10.0 Forks (GitHub): 4 Estrelas (GitHub): 4 Sem marcação · Visto pela primeira vez |
Não listado |
| Official MCP Registry | Não listado | Listado Versão: 0.37.0 Downloads por mês (PyPI): 4 218 Downloads por semana (PyPI): 751 Forks (GitHub): 9 Estrelas (GitHub): 45 Sem marcação · Visto pela primeira vez |
Cada número é do próprio marketplace e nunca é somado entre marketplaces. Um marketplace que não publica números não mostra nenhum: sem número não é zero.
Os fatos lado a lado
| Fato | biotopenão está mais listado · | Kindex |
|---|---|---|
| Marketplaces que o listam (diferente) | 0 | 2 |
| Estrelas (GitHub) (diferente) | 4 | 45 |
| Forks (GitHub) (diferente) | 4 | 9 |
| Último release (diferente) | Não publicado | 2026-10-15 |
| Onde roda (diferente) | Instala-se como pacote de plugins | Na sua máquina (kindex) |
| Transporte (diferente) | Não informado | stdio |
| Ferramentas que declara | Não publicado | Não publicado |
| Variáveis de ambiente que pede | Não publicado | Não publicado |
| Hooks que executa (diferente) | Não publicado | 7 |
| Partes do pacote (diferente) | 2 | 9 |
| Licença (diferente) | Não informado | MIT |
| Repositório (diferente) | github.com/biocypher/biotope | github.com/wandercom/kindex |
| Mudanças nos últimos 7 dias (diferente) | 2 | 0 |
| Visto pela primeira vez (diferente) | 2026-10-14 | 2026-10-11 |
As linhas em que os dois diferem têm fundo destacado e valores em negrito. Nenhum valor é marcado como melhor ou pior: um plugin que nenhum marketplace lista mais aparece com os últimos dados conhecidos, que não comparamos com números atuais.
O que usar no lugar de «biotope»
Plugins ainda listados cujos nomes, descrições, ferramentas e skills são os mais próximos em significado. Comparáveis, não recomendados.
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Deterministic Software Graph analysis via Ontoly CLI and MCP
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Construct, inspect, visualize, and simulate evidence-backed ODE models with BioMASS
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197 ready-to-use life sciences skills that turn Claude into a domain expert for genomics, proteomics, drug discovery, biostatistics, scientific computing, and scientific writing…
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editing-obo-ontologies
Skills and tools for editing OBO format ontologies
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MCP server + skill for the Loveliness clustered graph database (Cypher, bulk load, schema, cluster status)
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robot-obo-tool
Skills for using ROBOT, the OBO ontology command-line toolkit for reasoning, templates, quality control, and ontology manipulation
O que cada um diz que faz
biotope
Source curation and typed Python graph construction with Biotope and BioCypher.
Kindex
Persistent knowledge graph and MCP server for AI workflows with git-tracked project context.
Como executar cada um
biotope
Sem dados para um comando automático: o que os marketplaces declaram não diz de forma inequívoca como conectá-lo.
Kindex Como servidor MCP local: pacote PyPI
claude mcp add --transport stdio kindex -- uvx kindexComandos construídos apenas com o que os marketplaces declaram; o conjunto completo para cada cliente está no cartão de cada um.
Ferramentas que cada um declara
Os marketplaces de nenhum dos dois publicam uma lista de ferramentas, então não há o que comparar.
Configurações que cada um pede
Os marketplaces de nenhum dos dois publicam as configurações que ele pede.
O que pode fazer: biotope · O que pode fazer: Kindex · Comparar outros dois plugins
Dados de Community GitHub marketplaces. Dados de Official MCP Registry. Os números vêm das nossas próprias passagens regulares pelos marketplaces, última leitura em . Não publicamos dados de contato dos editores de plugins.