Pdbe
PDBe (Protein Data Bank in Europe, EBI) MCP.
MCP-сервер · от pipeworx-io
Коротко
Pdbe: MCP-сервер, издатель pipeworx-io. Витрин, которые мы читаем и где он опубликован: 1 (Official MCP Registry). Мы впервые увидели его 2026-10-11 и с тех пор изменений не фиксировали. Данные нашего прохода по витринам на 2026-10-14.
Что просит
- Работает удалённо
Ни одна из витрин, которые мы читаем, не публикует его инструменты или настройки, которые он просит.
Что объявляет, просит и запускает, полностью
Устанавливайте плагины только от разработчиков, которым доверяете. Мы показываем то, что публикуют витрины, и не проверяем плагины.
Работает с
- Claude Code
- Codex
- Cursor
- VS Code
- Copilot CLI
Ссылка в один клик открывает клиент, и он просит подтвердить, прежде чем добавить сервер.
По маркетплейсам, где он опубликован, и объявленному транспорту MCP, как их документирует каждый клиент. Плагины мы не тестируем.
Подключить
Команды и конфигурации собраны только из того, что объявляют витрины. Мы не запускаем их за вас и не проверяем плагины.
Как удалённый MCP-сервер
Собрано из того, что объявляет Official MCP Registry.
claude mcp add --transport http pdbe https://gateway.pipeworx.io/pdbe/mcp
[mcp_servers.pdbe]
url = "https://gateway.pipeworx.io/pdbe/mcp"
{
"mcpServers": {
"pdbe": {
"url": "https://gateway.pipeworx.io/pdbe/mcp"
}
}
}
Где опубликован
| Витрина | Статус | Версия | Числа | Проверен | Впервые замечен |
|---|---|---|---|---|---|
| Official MCP Registry (Открыть запись реестра) | Опубликован | 0.1.2 | Форки (GitHub): 0 Звёзды (GitHub): 0 |
Не помечен |
Каждое число принадлежит своей витрине и никогда не складывается с числами других витрин. Если витрина число не публикует, мы его не показываем: нет числа не значит ноль.
Что менялось
С тех пор как мы следим за плагином, ничего не менялось.
Похожие плагины
Продукты, чьи собственные названия, описания, инструменты и скиллы ближе всего по смыслу к этому, на всех витринах, которые мы читаем. Близость упорядочена только внутри этого списка.
-
EMDB (EBI Electron Microscopy Data Bank) MCP — keyless.
-
RCSB PDB MCP — experimentally determined macromolecular structures.
-
EBI PRIDE Archive MCP — proteomics (mass-spectrometry) data repository.
-
PeeringDB MCP — the peering ecosystem database.
-
Paleobiology Database (PBDB) MCP — the global fossil record. Keyless.
-
UniProt MCP — protein sequence + function database.
-
protein-mcp-server io.github.cyanheads/protein-mcp-server
MCP Server for 3D protein structural data retrieval & analysis from RCSB PDB, PDBe, and UniProt.
-
ChEMBL MCP — drug discovery database (EBI).
-
AlphaFold DB MCP — predicted protein structures.
-
STRING-DB MCP — protein-protein interaction networks.
Похожие плагины по витринам
Тот же вопрос к каждой витрине по отдельности: есть ли там аналог этого плагина?
Есть на витрине Claude Code: claude-plugins-community (5)
-
mdk-mcp-server io.github.SAP/mdk-mcp-server
Model Context Protocol (MCP) server for AI-assisted development of MDK applications.
-
Interactively explore MCP server tools and their input schemas. mcpx lets you drill down from server → tool → schema to understand what each tool expects. Browse all configured…
-
Multi-model deliberation over MCP: full responses plus typed cross-model reactions from other labs.
-
Zero-config MCP server for searchable documentation. SQLite or PostgreSQL.
-
mcp-server io.github.cap-js/mcp-server
Model Context Protocol (MCP) server for AI-assisted development of CAP applications.
Есть на витрине Claude Code: claude-plugins-official (5)
-
mdk-mcp-server io.github.SAP/mdk-mcp-server
Model Context Protocol (MCP) server for AI-assisted development of MDK applications.
-
mcp-server io.github.cap-js/mcp-server
Model Context Protocol (MCP) server for AI-assisted development of CAP applications.
-
Skills for designing and building MCP servers that work seamlessly with Claude. Guides you through deployment models (remote HTTP, MCPB, local), tool design patterns, auth, and…
-
MCP server for terminal commands, file operations, and process management
-
An authenticated hosted MCP server that accesses your PlanetScale organizations, databases, branches, schema, and Insights data. Query against your data, surface slow queries, and…
Есть на витрине Claude: knowledge-work-plugins (5)
-
MCP server for terminal commands, file operations, and process management
-
An authenticated hosted MCP server that accesses your PlanetScale organizations, databases, branches, schema, and Insights data. Query against your data, surface slow queries, and…
-
Figma design platform integration. Access design files, extract component information, read design tokens, and translate designs into code. Bridge the gap between design and…
-
Prisma MCP integration for Postgres database management, schema migrations, SQL queries, and connection string management. Provision Prisma Postgres databases, run migrations, and…
-
Search companies and contacts, enrich leads, find lookalikes, and get AI-ranked contact recommendations. Pre-built skills chain multiple ZoomInfo tools into complete B2B sales…
Есть на витрине Codex: openai-curated (openai/plugins) (5)
-
Predict structures, screen molecules and proteins, and design binders.
-
General life-sciences research workflows with query routing, evidence synthesis, and optional parallel subagent analysis across genetics, omics, biology, chemistry, structure…
-
Manage Supabase projects directly through ChatGPT. Execute SQL queries on PostgreSQL databases, design and modify table schemas, deploy serverless edge functions, and configure…
-
Use MagicPath to find, inspect, install, create, and edit UI components from Codex.
-
Bring operational data and context into the flow of your ChatGPT conversations. You can ask questions, create and update records, and analyze your data—all through conversation…
Есть на витрине Community GitHub marketplaces (5)
-
Build, audit and repair Power BI Desktop models and PBIP reports with DAX, TMDL and PBIR.
-
Database MCP server for schema discovery, comments, and SQL queries.
-
MCP bridge to the Tabellum database client: schema, reads, SQL drafts; writes approved in the app.
-
basicdeploy-mcp io.github.AkaciaNL/basicdeploy-mcp
The runtime your agent deploys to — DB, storage, and a public URL in one MCP call.
-
pbirb-mcp io.github.mafaq229/pbirb-mcp
MCP server for editing Power BI Report Builder paginated reports (RDL)
Есть на витрине Copilot CLI: github/awesome-copilot (5)
-
Complete toolkit for building Model Context Protocol (MCP) servers in TypeScript/Node.js using the official SDK. Includes instructions for best practices, a prompt for generating…
-
Complete toolkit for building Model Context Protocol (MCP) servers in Go using the official github.com/modelcontextprotocol/go-sdk. Includes instructions for best practices, a…
-
Build Model Context Protocol (MCP) servers in Python with the official MCP Python SDK v2 (MCPServer). Includes a skill that generates a server project and an expert agent for…
-
Comprehensive resources for building Model Context Protocol servers using the official PHP SDK with attribute-based discovery, including best practices, project generation, and…
-
Complete toolkit for building Model Context Protocol (MCP) servers in Kotlin using the official io.modelcontextprotocol:kotlin-sdk library. Includes instructions for best…
Есть на витрине Copilot CLI: github/copilot-plugins (5)
-
mcp-apps
Generate MCP App widgets for MCP tools. Produces self-contained HTML widgets using the MCP Apps protocol.
-
power-automate
Build, edit, run, and debug Power Automate cloud flows via the FlowAgent MCP server — connection lifecycle, surgical edits, copy across environments, run management, and validated…
-
Build Power Apps Canvas Apps using the Canvas Authoring MCP server.
-
model-apps
Build and deploy Power Apps generative pages for model-driven apps with specialist agents for planning, entity creation, and parallel code generation. Requires PAC CLI >= 2.7.0…
-
code-apps-preview
Build and deploy Power Apps code apps using React, Vite, and Power Platform connectors.
Есть на витрине Cursor: cursor/plugins (5)
-
Let Grok Bot reach MCP servers on your private Tailscale network. Sign in to Tailscale to connect your tailnet; Grok Bot joins it as one tagged device and only reaches the hosts…
-
Work with PostHog from chat: query product analytics and run SQL, manage feature flags and experiments, triage error tracking issues, and review session replays, surveys, and…
-
Search docs, read pages, and update tables.
-
Build apps, scripts, and automations with the TypeScript SDK.
-
if you want to go fast, go deep first. pstack helps you write less, but higher quality code. rigorous agent workflows you can parallelize with confidence.
Есть на витрине Docker MCP Catalog (5)
-
Official ClickHouse MCP server for querying and exploring ClickHouse clusters and chDB.
-
Remote MCP server for the Hackle Admin API: experiments, feature flags, remote config, messaging.
-
Dynatrace-mcp io.github.dynatrace-oss/Dynatrace-mcp
[DEPRECATED] Dynatrace MCP Server. Migrate to dynatrace-for-ai or Dynatrace Remote MCP Server.
-
Access to Rube's catalog of remote MCP servers.
-
mcp-server-couchbase io.github.Couchbase-Ecosystem/mcp-server-couchbase
Couchbase Model Context Protocol Server to interact with Couchbase clusters
Есть на витрине Official MCP Registry (5)
-
EMDB (EBI Electron Microscopy Data Bank) MCP — keyless.
-
RCSB PDB MCP — experimentally determined macromolecular structures.
-
EBI PRIDE Archive MCP — proteomics (mass-spectrometry) data repository.
-
PeeringDB MCP — the peering ecosystem database.
-
Paleobiology Database (PBDB) MCP — the global fossil record. Keyless.
Найдено по смыслу, а не по общему коду или репозиторию: похожие плагины остаются разными продуктами, и это не обзор и не рекомендация.
Это ваш плагин?
Добавьте плагин в свои проекты и докажите, что поддерживаете его: файлом в репозитории, файлом на вашем домене или DNS-записью. Вы будете получать уведомления, когда витрина добавит плагин, снимет его, изменит отметку verified или список того, что он просит, а его удалённый endpoint встанет на мониторинг как веб-сервис.
Данные витрины Official MCP Registry. Числа взяты из наших регулярных обходов витрин, последняя проверка . Контакты издателей плагинов мы не публикуем.