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io.github.cyanheads/gnomad-genetics-mcp-server

Ancestry allele frequencies, LoF constraint, variant lists, and coverage from gnomAD, with ClinVar.

Serveur MCP · par cyanheads

Aperçu

io.github.cyanheads/gnomad-genetics-mcp-server est un serveur MCP publié par cyanheads. Places de marché que nous lisons et qui le référencent : 1 (Official MCP Registry). Le dernier changement enregistré date du 2026-10-15. Selon notre passage sur les places de marché du 2026-10-17.

Ce qu'il demande

  • S'exécute à distance
  • Paramètres : 6

Ce qu'il déclare, demande et exécute, en détail

N’installez que des plugins de développeurs en qui vous avez confiance. Nous reprenons ce que publient les places de marché et ne testons pas les plugins.

Paquet

npm @cyanheads/gnomad-genetics-mcp-server (@cyanheads/gnomad-genetics-mcp-server sur npm)

  • Téléchargements npm par semaine: 89 (2026-10-15)
  • Téléchargements npm par mois: 903 (2026-10-15)
  • Dernière version sur npm : 0.4.1, publiée le 2026-10-14

Les données npm proviennent du registre public npm (registry.npmjs.org, api.npmjs.org). Chaque chiffre est celui du registre et ne s'additionne jamais à un autre. Un registre qui ne publie pas de chiffre n'en affiche aucun : pas de chiffre ne veut pas dire zéro.

Fonctionne avec

  • Claude Code
  • Codex
  • Cursor
  • VS Code
  • Copilot CLI

Un lien en un clic ouvre le client, qui demande une confirmation avant d'ajouter le serveur.

D'après les marketplaces qui le listent et le transport MCP qu'il déclare, tels que chaque client les documente. Nous ne testons pas les plugins.

Observé par Ext Ops

Observé par Ext Ops le 2026-10-16 : ce que l'endpoint lui-même a répondu quand on lui a demandé de lister ses outils. Nous n'appelons jamais les outils.

Outils : 7 · Ressources : 0 · Prompts : 1

Serveur : gnomad-genetics-mcp-server 0.4.1 · version du protocole MCP 2025-06-18

Métadonnées des outils selon la liste du 2026-10-16 : annotations sur 7 outils sur 7 · descriptions sur 31 paramètres sur 31.

  • gnomad_dataframe_describeList the tables staged on a canvas and their columns (name and type) so you can write correct SQL for gnomad_dataframe_query. Use the canvas_id returned by gnomad_list_gene_variants or gnomad_search_…
  • gnomad_dataframe_queryRun a read-only SQL SELECT against a canvas table staged by gnomad_list_gene_variants (table gene_variants) or gnomad_search_clinvar (table clinvar_variants) and return one page of the result. Use th…
  • gnomad_get_coverageFetch gnomAD sequencing-coverage summary across a gene, transcript, or region — mean and median read depth, plus the mean fraction of samples covered at each depth threshold (1× through 100×), separa…
  • gnomad_get_gene_constraintFetch gnomAD loss-of-function constraint for a gene — pLI (probability of LoF intolerance; >0.9 intolerant), LOEUF (oe_lof_upper, the headline metric) plus its lower bound, observed/expected ratios f…
  • gnomad_get_variantFetch the full gnomAD population record for one or more variants — allele count/number/frequency overall and broken down per genetic-ancestry group, homozygote and hemizygote counts, quality flags, t…
  • gnomad_list_gene_variantsList every gnomAD variant in a gene, transcript, or region with allele frequencies and predicted consequences, optionally filtered to one consequence class (lof, missense, synonymous, other) and/or a…
  • gnomad_search_clinvarSearch ClinVar (NCBI E-utilities) for a gene and return its classified variants — clinical significance, review status with a 0–4 star rating, associated conditions, molecular consequences, submissio…

Ses marketplaces ne publient pas de liste d'outils.

Comment nous vérifions les endpoints

Connecter

Commandes et configurations construites uniquement à partir de ce que déclarent ses places de marché. Nous ne les exécutons pas pour vous et ne testons pas les plugins.

En serveur MCP distant

Construit à partir de ce que déclare Official MCP Registry.

Claude CodeTerminal
claude mcp add --transport http gnomad-genetics-mcp-server https://gnomad-genetics.caseyjhand.com/mcp
Codex~/.codex/config.toml
[mcp_servers.gnomad-genetics-mcp-server]
url = "https://gnomad-genetics.caseyjhand.com/mcp"
Cursor~/.cursor/mcp.json
{
  "mcpServers": {
    "gnomad-genetics-mcp-server": {
      "url": "https://gnomad-genetics.caseyjhand.com/mcp"
    }
  }
}

Où il est publié

Place de marchéStatutVersionChiffresVérifiéVu pour la première fois
Official MCP Registry (Ouvrir la fiche du registre) Référencé 0.4.1 Téléchargements par mois (npm): 903
Téléchargements par semaine (npm): 89
Forks (GitHub): 0
Étoiles (GitHub): 1
Non marqué

Chaque chiffre est celui de la place de marché et n'est jamais additionné entre places de marché. Une place de marché qui ne publie pas de chiffre n'en affiche aucun : pas de nombre ne veut pas dire zéro.

Ce qui a changé

  1. Official MCP Registry: description modifiée
  2. Official MCP Registry: variables d'environnement modifiées (désormais 6): ajouté : MCP_TRANSPORT_TYPE
  3. Official MCP Registry: version 0.4.1 publiée (avant 0.4.0)
  4. Official MCP Registry: arguments de lancement modifiés: retiré : <>

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Prouvez que vous le maintenez avec un fichier dans son dépôt, un fichier sur votre domaine ou un enregistrement DNS, et vous pourrez afficher cette marque sur la fiche, avec des bannières à jour pour votre site et votre README. Comment se passe la vérification

Vous recevez aussi des alertes quand une marketplace le publie, le retire, change sa marque vérifiée ou ce qu'il demande, et son endpoint distant est surveillé comme un service web.

Données issues de Official MCP Registry. Les chiffres proviennent de nos propres passages réguliers sur les places de marché, dernière lecture le . Nous ne publions aucune coordonnée des éditeurs de plugins.

D’où viennent les données : comment le catalogue est construit